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1、网络安全应急技术国家工程实验室：针对重大突发网络和信息安全事件预警、分析、处置的需求，建设网络安全事件安全防护、监测预警和应急处置的实验平台，研究数据高速捕获查询、海量存储、数据信息挖掘等大规模网络安全应急的重大技术问题，开展国家级网络安全监控体系建模、重大突发网络安全事件实时监控和网络安全态势分析预测关键核心技术研发，以提升国家网络安全应急工作水平，为保障国家信息基础设施，重要信息系统安全稳定运行提供技术支撑。
2、信息安全等级保护关键技术国家工程实验室：针对互联网的重要信息系统安全防护需求，建设信息安全等级保护关键技术研究、示范实验平台，研究防范阻止、检测发现、应急处置、审计追查、集中管控等安全保护策略和机制，开展安全审计、强制访问控制、系统结构化、多级系统安全互联访问控制、产品符合性检验等关键技术的研究，在此基础上研发用于保护重要信息系统的安全计算环境、安全区域边界、安全通信网络和安全管理中心的核心技术产品，为重要信息系统安全管理和防护提供技术支撑。
3、互联网域名管理技术国家工程实验室：针对互联网安全保障和健康发展的需要，开展域名安全管理、IP地址管理、根服务器、域名系统安全协议（DNSSEC）、域名系统防护、中文域名等关键技术和系统的研究，建立域名管理技术研究开发及测试验证平台，建设域名真实信息注册管理系统、违法域名监管系统、域名服务应急管理系统，为保障国家基础信息网络安全运行，规范互联网域名服务管理提供技术支撑。
4、移动互联网安全技术国家工程实验室：针对移动互联网快速发展面临的网络和信息安全问题，建设移动互联网安全技术研究、仿真、验证与测试平台。研究未来移动通信无线接入、信号处理、传输的安全技术，IPv6移动互联网安全管理技术，新业务安全管理与评估技术，移动终端和系统安全检测与防护技术。开展相关标准的研究制订工作，研究推动国内移动互联网安全相关标准体系建立，为保障国家移动互联网安全运行和健康发展提供技术支撑。
5、工业控制系统安全技术国家工程实验室：针对炼油、化工、电力、电网、水厂、交通、水利等基础设施的工业控制系统免受“震网”、“毒区”等病毒攻击的安全需求，建设工业控制系统安全模拟平台。研究工业控制系统的安全防护策略和机制，开展工业控制系统监控软件、嵌入式软件、现场总线等方面的安全渗透与对抗、脆弱性检测、安全评估、安全防护等关键技术的研究；结合典型行业的工程应用与生产现场实施，研究推动工业控制系统信息安全标准体系的建立，研发用于保护工业控制系统的核心技术产品，为国家重要基础设施的工业控制系统安全管理和防护提供技术支撑。
6、计算机病毒防治技术国家工程实验室：针对保障国家基础信息网络安全，防范黑客利用病毒、木马进行网络犯罪活动的技术需求，建设计算机病毒防治技术和产品研究、验证、测试平台，以及病毒监测与应急处理平台，研究计算机病毒防治基础理论，开展第三代移动通信技术（3G）和下一代互联网环境下的病毒检测、病毒特征提取、针对特定目标攻击（APT）检测、病毒捕获分析和取证等核心技术研究，以解决由虚拟化、云计算等新技术和3G、下一代互联网应用带来的病毒攻击破坏问题，为国家保障基础信息网络安全和防范网络犯罪提供技术支撑。
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