农业资源与环境综合调查。重点开展土壤资料的更新调查与数字化整理，水资源及利用状况调查，气候资源及灾情调查，作物种质资源调查，特种经济作物和动物资源调查，农业生物病（虫）原流行演替调查、农业障碍因子调查等。
　　环境与人群健康综合调查。重点开展地理环境、大气环境与人群健康影响关系调查及资料整编，不同地区危害健康的主要环境因素调查，现场流行病学调查，不同人群心理健康调查，中国人生理常数、人体工效学基础参数调查，中药种类资源调查等。
　　荒漠科学考察与调查。选择我国重点区域的戈壁、沙漠、沙漠化土地开展科学考察，收集地理分布、自然条件的基础数据，并开展形成与演变过程、发展趋势、自然资源开发利用等方面的调查工作。
　　海洋科学考察与调查。加强我国黄海、渤海、东海、南海等重点海域及近邻大洋的地质与资源环境科学考察，开展关键断面的长期观测、海岸带资源环境调查、海洋生物资源调查等工作。
　　湖泊、流域生态环境科学考察与调查。开展我国湖泊分布及水质、水量变化情况的调查，重点开展长江中下游通江湖泊、咸水湖泊等典型湖泊、流域等水资源、水生态、水环境的历史和现状综合科学考察。
　　湿地科学考察与调查。对我国重点区域的内陆湿地和滨海湿地开展科学考察，收集湿地水资源、泥炭资源等基础数据，开展生态环境效益等方面的调查工作。
　　冰川科学考察与调查。重点对我国及边境高寒地区的冰川、冻土，以及冰川地貌和冰川气候等方面开展科学考察，收集冰川、冻土、气候、地质、环境资源等基础数据。
　　地球物理参数及标准地层科学考察与调查。重点开展我国大陆及海域的地球物理参数深部探测及数据更新，中国各地质年代标准地层的综合地层学考察。
　　周边毗邻地区科学考察。基于我国周边毗邻地区综合科学考察的已有工作基础，扩展科学考察的范围和深度，加强对东北亚、中亚、南亚和东南亚等毗邻地区，及跨境山脉、跨境河流、跨境成矿带等区域的资源环境综合科学考察。
　　全球典型区域科学考察。参与或主导国际和区域性的科学合作，联合开展跨国综合科学考察。重点加强在非洲、南美洲等典型区域的资源环境综合科学考察。
　　（二）科技资料整编和科学典籍、志书、图集的编研
　　“十二五”期间，重点开展各学科领域在长期的科技活动过程中积累的基础数据和资料的整编以及典籍、志书、图集的编研，促进科技资料的共享和利用。

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