（一）财政部门负责总体工作牵头和组织协调。主要职责是：组织农业、水利、农机部门共同商定项目区、项目县、项目的投资规模；按最终确定的投资规模安排年度预算指标，落实并保证配套资金足额到位；审查、汇总部门项目规划，组织农业、水利、农机部门共同审定下一级项目规划和共同审核报送本级项目规划；督促规划实施；拨付资金，汇审财务决算，监督资金使用管理，及时反馈项目资金使用情况；会同主管部门进行竣工验收；建立资产登记档案；
（二）农业、水利、农机三个主管部门的主要职责是：编制、审查部门项目规划；组织督促项目建设；监督、检查施工进度、施工质量；收集、整理编报各种技术资料、表册；配合财政部门监督项目建设中的资金使用；验收竣工项目；建立资产登记档案；进行年度工作总结。
第二十七条 自给资金项目实行分层次管理。各省的自给工程建设为总项目，项目区的建设为分项目，项目县的建设为子项目。
第二十八条 财政部、农业部、水利部共同组成粮食自给工程立项单位；省级财政、农业、水利、农机部门共同组成项目总承包单位。总承包单位向立项单位负责，立项单位通过审批项目规划的形式明确总承包单位的经济责任。
报批立项的项目规划材料格式，由立项单位统一设计和颁发。
第二十九条 项目县的财政、农业、水利、农机部门为项目分承包单位；项目区覆盖的乡（镇）为子承包单位。分承包单位向总承包单位负责；子承包单位向分承包单位负责。其责任通过签订协议或承包合同明确。协议或承包合同的内容由各省制定。
第六条 项目管理程序
第三十条 立项单位根据国家粮食发展总体规划、自给资金的供求状况和前一投资期项目管理情况，确定每一投资期各项目总承包单位的自给资金意向性投资规模，总承包单位根据意向性投资规模确定项目区和项目县。
第三十一条 项目方案设计：项目区的方案设计内容，由立项单位制定，方案设计工作由总承包单位进行；项目县、项目的方案设计内容由总承包单位制定，方案设计工作由分承包单位和子承包单位进行。
第三十二条 项目方案按下列程序评估论证：
