五是重大动物疫病防控形势依然严峻。国内重大动物疫病防控形势依然严峻，布病、结核病、包虫病等人畜共患病有所抬头，严重威胁畜牧业发展和公共卫生安全。外来疫病防控难度大，周边国家禽流感等重大动物疫情持续发生，对我国疫病防控的威胁在短期内难以有效缓解。病毒变异速度的加快，也使得动物疫病防控难度不断加大。基层兽医防疫队伍素质不高，执业能力参差不齐，兽医系统培训平台和执业兽医体系尚未完善，履行《
动物防疫法》职责任务难度大。
六是生态环境制约日益凸显。随着社会公众环保意识的不断提高，环境保护和污染治理等系列法律法规的出台，对畜牧业污染防控提出了更高要求。由于畜禽养殖污染处理成本偏高，部分畜禽养殖者粪污处理意识薄弱，设施设备和技术力量缺乏，畜禽养殖污染已经成为制约现代畜牧业发展的瓶颈。
七是草原保护建设任务艰巨。近年来，虽然保护草原生态环境的观念逐步增强，但草原生态总体恶化的局面仍未能根本改变。目前，全国90%以上的可利用天然草原出现不同程度退化，人草畜矛盾突出，重点草原牲畜超载问题严重，草原畜牧业生产力不断下降。
二、指导思想、基本原则与发展目标
（一）指导思想
以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，按照高产、优质、高效、生态、安全的要求，始终坚持转变畜牧业发展方式“一条主线”，紧紧围绕保供给、保安全、保生态“三大任务”，着力构建畜禽标准化生产、畜禽牧草种业、现代饲草料产业、现代畜牧业服务、饲料和畜产品质量安全保障、草原生态保护支撑等“六大体系”，稳步提高畜产品综合生产能力，努力确保饲料和畜产品质量安全，加快提升草原生态保护建设能力和水平，为农业农村发展提供有力支撑。
（二）基本原则
坚持发展标准化规模养殖。转变养殖观念，调整养殖模式，在因地制宜发展适度规模养殖的基础上，加快改善设施设备保障条件，大幅度提高标准化养殖水平，积极推行健康养殖方式，促进畜牧业可持续发展。
坚持优化结构布局。大力调整优化畜牧业结构和布局，突出支持主产区和优势区发展，稳定非主产区生产能力，科学规划，统筹安排，分步实施，保障畜牧业稳定发展。
坚持数量质量发展并重。加强畜牧业综合生产能力建设和各环节质量控制，转变发展方式，实现畜牧业生产发展与资源、生态环境及社会需求之间的动态平衡，促进畜牧业健康发展。
坚持推进农牧结合。充分利用种养业资源和产品可循环利用特点，推行种养结合的产业发展模式，促进种养业副产品的资源化利用，实现畜牧生产与生态环境的协调发展。
坚持科技兴牧。依靠科技创新和技术进步，突破制约畜牧业发展的技术瓶颈，不断提高良种化水平、饲料资源利用水平、生产管理技术水平和疫病防控水平，加快畜牧业发展方式转变，推动畜牧业又好又快发展。
（三）发展目标
“十二五”时期，畜牧业生产结构和区域布局进一步优化，综合生产能力显著增强，规模化、标准化、产业化程度进一步提高，畜牧业继续向资源节约型、技术密集型和环境友好型转变，畜产品有效供给和质量安全得到保障，草原生态持续恶化局面得到遏制。
畜产品有效供给得到保障。到2015年，肉、蛋、奶产量分别达到8500万吨、2900万吨和5000万吨，羊毛产量达到43万吨，畜牧业产值占农林牧渔业总产值的比重达到36%。
质量安全水平进一步提升。饲料产品质量合格率达到95%以上。违禁添加物检出率控制在0.1%以下。生鲜乳收购站100%实现持证收购和标准化管理，生鲜乳质量安全保障机制更加健全。
畜牧业产业素质明显提高。到2015年，全国畜禽规模养殖比重提高10-15个百分点，存栏100头以上奶牛、年出栏500头以上生猪规模化养殖比重分别超过38%和达到50%；畜禽规模化养殖场（小区）粪污无害化处理设施覆盖面达到50%以上。畜禽良种繁育体系进一步健全完善，良种化水平明显提高。畜牧业组织化水平进一步提高，农民专业合作组织的经营规模和带动能力不断扩大和增强。
