水牛遗传改良要立足现有优势品种资源，加强保护和利用开发，扩大育种群规模，推进本品种选育提高。利用引进水牛优良品种，大力培育优秀种公牛，建立水牛人工授精体系，有计划地与国内地方水牛进行杂交，提高产肉性能。
（五）牦牛
牦牛是青藏高原地区特有的牛种。我国牦牛存栏1500多万头，占世界总数的95%。我国有1个培育品种（大通牦牛）和12个地方品种，有1个牦牛种公牛站和13个种牛场。近年来，相继开展了部分地方品种的本品种选育和牦牛杂交改良工作，大幅度提高了生产性能。但牦牛养殖区域生存条件严酷，改良工作与其他牛种相比难度大，普遍采取自然交配的模式，人工授精覆盖面低。牦牛育种场少，育种群规模小，制种供种能力低，缺乏科学选育和种质交换，近亲繁殖严重，致使牦牛繁殖力和生长速度下降。
牦牛遗传改良以提高生产性能和种群供种能力为主。在加强地方牦牛品种保护的同时，对大通牦牛等品种要加强种牛场建设，扩大生产性能测定规模，提高种公牛供种能力。要积极推广优良种公牛本交，提高主产区牦牛的生产性能。在有条件的地区，有计划推广人工授精杂交改良技术，适当开展娟姗牛、安格斯等品种杂交改良工作，提高群体的产肉性能。
四、主要工作内容
根据各个牛种的遗传改良现状和今后发展趋势，有选择、有重点地实施部分主要进口品种和国内品种的遗传改良工作，制定具体的遗传改良计划，重点加强核心育种场、生产性能测定、主要疫病监测净化、品种登记、新品种培育、人工授精体系等方面的建设。
（一）遴选国家肉牛核心育种场
1. 实施内容
制定国家肉牛核心育种场遴选标准，采用企业自愿、省级畜牧兽医行政主管部门审核推荐的方式，选择50个国家肉牛核心育种场。
2. 任务指标
2020年前分批完成50个国家肉牛核心育种场的评估遴选，筛选出核心育种群1.5万头，配套相关育种设施设备，建立育种场和种公牛站的育种联结机制。
（二）建立种牛生产性能测定体系
1. 实施内容
制定实施肉牛种牛生产性能测定标准和管理规程，开展育种场为主的场内生产性能测定。在肉牛优势区域建设4个国家级和部分省级生产性能测定中心，负责区域内的种牛生产性能测定。建设和完善国家级肉牛遗传评估中心，负责遗传数据的收集、处理和发布。
2. 任务指标
肉牛核心育种场按照要求开展测定，及时上报有关数据。参加生产性能测定肉牛数量年均达到8000头，到2025年累计测定数量达到10万头以上。通过性能测定和个体选择，每年选出优秀种公牛200头以上。
