(一)围绕中心，服务大局。
围绕动植物检验检疫事业科学发展这一中心，努力构建具有中国特色动植物检验检疫体系。从国家经济社会发展大局出发，服务产业结构调整和经济发展方式的转变，促进经济社会和谐发展。
(二)保障安全，促进发展。
完善防范外来有害生物入侵体系和出口农产品质量安全保障体系，强化农产品进出口宏观调控作用，保障农牧渔业生产安全、生态安全和人民生命健康安全，服务“三农”工作，促进经济社会可持续发展。
(三)创新机制，提升能力。
以科学为依据，以风险管理为核心，以先进的技术手段为基础，创新动植物检验检疫工作机制，改革监管模式，加强专业人才队伍和科学决策能力建设，强化检验检疫技术研究，全面提升服务经济社会发展的能力。
(四)深化合作，协同把关。
深入研究和把握新形势下动植物检验检疫工作的特点和规律，正确判断检验检疫事业发展的走向和趋势，加强与国内涉农涉外部门的联系，深化合作机制研究，推动大质量工作机制和大质检文化建设，深入推进双边国际合作，积极参与国际动植物检疫规则的制定，扩大在国际动植物检疫领域的影响力和话语权。
五、发展目标
到2015年，完成中国特色进出境动植物检验检疫体系理论研究；进出境动植物检验检疫法规体系、标准体系进一步健全，主要业务全部达到有章可依；进出境动植物检验检疫决策机制进一步完善，建立科学的决策机制和督查机制；进出境动植物检验检疫资源配置进一步合理，机构设置和人员配备能够覆盖进出境动植物检验检疫各项业务；基础设施和技术装备进一步改善，进出境口岸建立与进出境动植物检验检疫业务相配套的防疫设施、查验设施、处理设施，建立1-2个具有国际参考实验室资格或者相应水平的实验室；风险预警能力进一步加强，建立依托标准法规、疫情信息、疫情截获、疫情和有毒有害物质监测为基础的预警信息化系统；把关和服务的有效性进一步提高，动植物疫情和有毒有害物质截获率保持适度水平，出口农产品质量安全合格率达到和超过发达国家水平，农产品进出口市场进一步扩大；队伍素质进一步提高，科技兴检、人才强检、法治质检战略深入实施，所有专业人员均能获得培训学习的机会。
六、主要任务
(一)基础建设。
1．理论研究
1．1组织并完成中国特色进出境动植物检验检疫理论体系研究：通过总结进出境动植物检验检疫历史经验，正确分析我国进出境动植物检验检疫工作特性，明确中国特色进出境动植物检验检疫理论内涵，体现中国特色进出境动植物检验检疫科学发展规律。
1．2组织并完成进出境动植物检验检疫对经济社会发展的贡献率模型研究：通过分析进出境动植物检验检疫各项工作与国家经济社会发展的关联及其权重，建立数学分析模型，有效评估进出境动植物检验检疫对经济社会发展的贡献率。
2．法规标准
