贯彻“国家主导、资源共享、自主创新、培育产业”的基本原则，紧密围绕我国能源、资源、环境和农村发展等的战略需求，努力提高技术与产品研发的起点，抢占生物制造科技发展的战略高地，实行分类管理，努力实现前沿技术创新，重点突破关键与共性技术，打造具有知识产权的核心产业技术体系。注重发挥高校和科研院所在创新中的引领作用，推进企业在技术创新中主体地位，注重产学研用的有机结合，加强产业化推进。
三、发展目标
（一）实施目标。
到“十二五”末期，初步建成现代生物制造创新体系，突破一批核心关键技术，提升生物制造产业技术水平与国际竞争力，带动形成现代生物制造产业链，生物制造领域技术水平进入世界先进行列，推动我国经济结构调整，加快转变经济发展方式。
（二）具体目标。
1．生物制造科技创新能力大幅提升。解决生物催化剂、人工生物体、复杂生物过程等三方面的科学问题，重点突破合成生物学、微生物基因组育种、工业酶分子改造等核心技术，建成一批国际先进水平的创新平台与研发基地，形成一批成果转移转化创新基地。
2．关键技术实现创新，产业支撑能力明显增强。应用合成生物技术、微生物基因组育种、工业酶分子改造等核心技术，推动生物炼制、生物催化、生物加工、先进发酵等关键技术创新，开发生物能源、生物塑料、生物纤维、生物溶剂、工业酶、重大化学品等重大先进生物制造产品30种以上，实现生物印染、生物漂白、生物制革、生物脱胶等一批绿色生物工艺关键技术示范，革新化学中间体、高值化学品等生产的化学工艺，促进纺织、造纸、制革、化工等工艺的绿色转型升级。
3．初步形成生物制造经济与社会影响。促进形成一个现代生物制造产业链，带动新增工业产值1000亿元， 20个生物制造产业示范园区（基地），增加10万个就业岗位。实现一批工业过程的绿色生物工艺转型升级，能源消耗与污染物排放减少30％以上。提高若干重大生物发酵产品的技术水平，显著增强生物制造产业的国际竞争力。
四、重点任务
围绕国家重大战略需求与专项规划总体目标的实现，重点解决生物制造的原料利用、产品成本与过程效率等相关科技问题，形成我国现代生物制造技术体系，实现产业化应用，促进生物制造战略性新兴产业的形成与发展。
（一）解决现代生物制造的重大科学问题。
面对我国经济社会发展方式转变和新一轮科技革命带来的挑战，加强生物制造科技的前瞻性基础研究，解决生物制造的重大科学问题，引领未来高新技术发展。
发展重点：
1．生物催化与生物转化的基础科学问题。
开展工业酶蛋白与生物催化剂的结构与功能研究，解决生物催化、生物质原料转化、生物分子机器等重要科学问题，为建立高效生物催化技术奠定科学基础，提高我国基础化学品、手性化学品与特殊化学品等有机化学品生物合成的核心竞争力与发展的可持续性。
