（三）现代生物制造是推动我国经济结构调整、转变经济发展方式的内在需求。
近年来，我国GDP每年以10%左右的速度增长，对化石能源与石油化工原料的需求旺盛和依赖程度较大。2010年，我国原油进口量达2.4亿吨，对外依存度达到55%，已超过50%的警戒线，依赖于石油炼制的大宗化工原料和能源的短缺与高价，已经成为我国工业经济发展的制约性因素。寻求可再生的能源与化学品，减少对石油资源的依赖，已经成为我国经济发展的迫切需求。同时，我国工业的能耗、物耗与环境污染物排放水平居高不下，严重制约着我国工业经济的可持续发展。
用于生物制造的可再生生物质资源包括糖、油脂、非粮生物质、有机废弃物，甚至以工业废气、二氧化碳（CO2）等为原料，生产一系列能源与化工产品，生产与石油炼制类似的基本化工原料、溶剂、表面活性剂、化学中间体、以及塑料、尼龙、橡胶等高分子材料。理论上90%的传统石油化工产品都可以由生物制造获得，是石油替代战略中的一个重要突破口。发展生物制造，以微生物细胞工厂构建石油化工产品的合成通道，以生物可再生资源替代化石资源的工业原料路线，加大绿色、低碳、可再生的生物能源与生物基化学品比重，有助于重组我国石油化工原料结构、降低石油资源依赖、减少CO2排放、实现低碳经济与工业可持续发展。同时利用工业废弃物、城市和农村生活垃圾等为原料，可实现废物资源化、生态环境友好协调发展，对改善民生有重要推动作用。
（四）现代生物制造是提高我国生物产业效率、增强国际竞争力的迫切需要。
目前我国主要传统生物技术产品的年产值高达6600亿元，在国民经济中占有较高的比重，但存在着高生产成本、高资源消耗和高环境污染等缺陷。我国具有国际上工业发酵产业中的所有主要产业，就其规模而言，某些产业在世界上占有举足轻重的地位，并在生物基化学品、生物基材料、酶制剂、大宗发酵产品、精细化学品等领域已经掌握一批关键技术，但整体上与世界先进水平相比仍有较大差距。微生物工程菌与新型酶制剂的开发、产业化和工业规模应用明显落后于国外，特别是在分子生物学、系统生物学、合成生物学技术在工业微生物改造与应用方面严重滞后；在化学品制造领域，则基本停留在利用传统发酵技术生产简单代谢物的低端技术水平上；在重要医药中间体、精细化学品、手性药物等未来生物制造高端产品研发上落后于发达国家10年以上，由此导致我国企业利润率低于国外企业的2-4倍，在全球经济竞争中存在着巨大的风险，迫切需要基于微生物基因组与系统生物学、合成生物学为基础的现代生物制造技术，提高产业技术水平，增强国际竞争力。
二、发展思路与原则
（一）基本思路。
高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，积极促进经济发展方式转变，全面贯彻落实《纲要》，围绕以可再生碳资源取代化石资源的工业原料路线替代，以绿色高效生物催化剂取代化学催化剂的工艺路线替代，以现代生物技术提升传统生物化工产业的“两个替代、一个提升”，确立“抢占国际前沿制高点，培育战略性新兴产业增长点，突出现有产业技术升级改造，支撑领域自身创新发展”的基本发展思路，全面布局，重点突破，促进我国生物制造产业跨越式发展。
（二）基本原则。
