1、长江水系
长江水系高等级航道布局方案为“一横一网十线”。
“一横”：长江干线
“一网”：长江三角洲高等级航道网
以长江干线和京杭运河为核心，三级航道为主体，四级航道为补充，由23条航道组成“两纵六横”高等级航道网。两纵：京杭运河-杭甬运河（含锡澄运河、丹金溧漕河、锡溧漕河、乍嘉苏线），连申线（含杨林塘）；六横：长江干线（南京以下），淮河出海航道-盐河，通扬线，芜申线-苏申外港线（含苏申内港线），长湖申线-黄浦江-大浦线、赵家沟-大芦线（含湖嘉申线），钱塘江-杭申线（含杭平申线）。
“十线”：岷江、嘉陵江、乌江、湘江、沅水、汉江、江汉运河、赣江、信江、合裕线。
长江水系主要港口布局方案为16个：泸州港、重庆港、宜昌港、荆州港、武汉港、黄石港、长沙港、岳阳港、南昌港、九江港、芜湖港、安庆港、马鞍山港、合肥港、湖州港、嘉兴内河港。
2、珠江水系
珠江水系高等级航道布局为“一横一网三线”。
“一横”：西江航运干线
“一网”：珠江三角洲高等级航道网
以海船进江航道为核心，以三级航道为基础，由16条航道组成“三纵三横三线”高等级航道网。三纵：西江下游出海航道，白坭水道-陈村水道-洪奇沥水道，广州港出海航道；三横：东平水道，潭江-劳龙虎水道-莲沙容水道-东江北干流，小榄水道-横门出海航道；三线：崖门水道-崖门出海航道，虎跳门水道，顺德水道。
“三线”：右江、北盘江-红水河、柳江-黔江
珠江水系主要港口布局方案为5个：南宁港、贵港港、梧州港、肇庆港、佛山港。
3、京杭运河与淮河水系
京杭运河与淮河水系高等级航道布局为“一纵二线”。
“一纵”：京杭运河
“二线”：淮河、沙颍河
京杭运河与淮河水系主要港口布局方案为5个：济宁港、徐州港、无锡港、杭州港、蚌埠港。
4、黑龙江和松辽水系
黑龙江和松辽水系高等级航道布局为“二线”：黑龙江、松花江。
黑龙江和松辽水系主要港口布局方案为2个：哈尔滨港、佳木斯港。
5、其它水系
其他水系高等级航道布局为“一线”：闽江。
五、实施方案
