管理费用由参股基金企业支付，财政部不再列支管理费用。年度管理费用一般按照参股基金注册资本或承诺出资额的1.5-2.5%确定，具体比例在委托管理协议中明确。
第十八条 除对参股基金管理机构支付管理费外，参股基金企业还要对参股基金管理机构实施业绩奖励。业绩奖励采取 “先回本后分利”的原则，原则上将参股基金增值收益（回收资金扣减参股基金出资）的20%奖励参股基金管理机构，剩余部分由中央财政、地方政府和其他出资人按照出资比例进行分配。
第十九条 对投资于初创期创新型企业的资金比例超过基金注册资本或承诺出资额70%的参股基金，中央财政资金可给予更大的让利幅度。
第六章 受托管理机构
第二十条 财政部会同国家发展改革委通过招标确定中央财政出资资金受托管理机构，并签订委托管理协议。
第二十一条 受托管理机构应符合以下条件：
（一）具有独立法人资格；
（二）注册资本不低于1亿元人民币；
（三）从事创业投资管理业务5年以上；
（四）有至少5名从事3年以上创业投资相关经历的从业人员；
（五）有完善的创业投资管理制度；
（六）有三个以上创业投资项目运作的成功经验；
（七）有作为出资人参与设立并管理创业投资基金的成功经验；
（八）最近三年以上持续保持良好的财务状况，没有受过行政主管机关或司法机关重大处罚的不良记录，严格按委托管理协议管理中央财政出资资金。
第二十二条 受托管理机构的职责主要包括：
（一）对参股基金开展尽职调查、入股谈判，签订参股基金章程；
（二）代表中央财政出资资金以出资额为限对参股基金行使出资人权利并承担相应义务，向参股基金派遣代表，监督参股基金投向；
（三）通过招标在财政部指定的国库集中支付代理银行范围内开设托管专户，根据参股基金章程约定，在地方政府、其他出资人按期缴付出资资金且足额到位后，将中央财政出资资金拨付参股基金账户；
（四）及时将中央财政出资资金的分红、退出等资金（含本金及收益）拨入托管专户并上缴中央国库；
（五）定期向财政部、国家发展改革委报告参股基金运作情况，股本变化情况及其他重大情况；
