第七条 各地应以政府投入为主，统筹利用各类资金，多渠道筹集落实项目建设资金，确保治理项目的顺利实施。中部地区所需地方资金应主要由省、地市两级财政负责解决，西部地区及参照西部政策的县，地方资金全部由省、地市两级财政负责解决。
第二章 前期工作
第八条 中小河流治理项目要服从流域防洪规划，治理标准要与干流、区域防洪除涝标准相协调。对一条河流上的多个河段进行治理，原则上先规划、后设计，统筹整条河流治理，防止洪水灾害转移。地方政府要切实落实和保障前期工作经费，做好项目储备，依据国家规划等相关要求抓紧开展项目初步设计等前期工作，经批准后组织实施。
第九条 省级水行政主管部门负责组织、指导项目前期工作，督促项目实施单位按规定选择具备相应资质的设计单位编制建设项目初步设计报告。有条件的地方可采取项目打捆方式招标勘察设计单位，通过招标竞争方式选择实力强、技术水平高的勘察设计总承包单位统一勘察、统一设计。初步设计报告由省级水行政主管部门会同省级财政主管部门审批，其中涉及省际河段的建设项目，须经流域机构复核后审批。建设项目涉及征地、环保等，应履行相应程序。
第十条 省级水行政主管部门应建立项目前期工作责任制，项目实施单位要对前期工作质量和进度负总责，审查单位要严把审核关，确保建设项目前期工作质量和深度。各流域管理机构负责按年度开展对流域内项目初步设计报告进行抽查。地方政府要严格按照批复的初步设计概算组织实施。设计变更应履行相应程序，重大设计变更应报原审批部门审批。
第三章 专项资金奖补范围、原则和标准
第十一条 专项资金奖补范围为全国中小河流治理专项规划确定的项目，以及根据国务院要求，经财政部、水利部认定的其他重点中小河流治理项目。
第十二条 中央根据专项规划、地方项目实施进度、已完工项目绩效评价结果和年度财政预算统筹安排年度专项资金，切块下达，由地方包干使用。省级人民政府负责统筹安排中央和地方资金，年度中央资金先到位时，省级政府可用中央资金先安排满一批项目，加快建设进度和预算执行；同时，切实落实地方资金，当年资金要当年落实，确保年度建设任务的完成。
