第八条 国家农发办根据开发县财政资金投资额度、项目种类、历年检查情况等因素，一般按不超过各省开发县总数百分之十的比例确定检查开发县的数量，但不得少于两个。
第九条 省级财政部门应当按照国家农发办综合检查通知要求，做好准备工作；需推迟综合检查的，应当提出书面申请，报国家农发办同意。
第十条 国家农发办一般在三个工作日前向被检查省级财政部门下达检查通知书，主要内容包括检查起始时间、检查开发县名单、检查组长和检查人员名单及联系方式等。
第十一条 国家农发办采取委托或直接组织的方式进行综合检查。
委托检查方式是由国家农发办委托专门机构组成检查组，独立开展检查工作，国家农发办派联络员协助工作。
直接组织检查方式是由国家农发办组成检查组，成员由财政部门人员及有关专家组成，按要求开展检查工作。
第十二条 检查组可采取听取汇报、查阅资料、抽查项目工程、走访农户、召开座谈会等方式进行综合检查。
检查人员应当运用对照检查的方法，核对资金支出与项目工程建设情况、项目工程规划设计与实际竣工工程情况、项目工程数量与质量情况，以及核对审计机关和其他有关部门查出问题的整改落实等情况，并将主要检查内容与事项予以记录或摘录，编制工作底稿。
必要时，检查组可以对有关问题进行延伸检查。
第十三条 检查组应当采取一定形式，将检查中取得的有关证明材料提请当地财政部门或被检查单位进行确认，未取得确认的应当注明原因。
国家农发办直接组织的检查组应当就检查基本情况、发现的问题和改进意见等事项与被检查省级财政部门交换意见。
第十四条 国家农发办通过专题会议的形式，听取综合检查工作汇报，复核综合检查情况，考评检查组工作，对被检查省的农业综合开发资金和项目管理工作提出综合评议意见。
第十五条 财政部向各省级财政部门通报综合检查情况，对工作取得的成绩给予肯定；对检查发现的问题提出整改要求，并按照有关规定作出处理决定或提出处理意见。
