适应财政改革要求，加强源头治理，建立健全部门预算、“三公经费”和会议费、国有资产、财务核算等管理办法，提高资金资产使用及财务核算的规范性和有效性。
一是完善综合预算制度。2011年6月-11月，按照部门预算编制要求，在认真编制2012年财政拨款收支计划的同时，认真编制其他资金（除财政拨款以外的事业收入、经营收入和其他收入）收支计划，保证将各项收入和支出全部编入部门预算。加强对其他资金的预算管理，进一步完善收支测算方法，提升其他资金预算编制质量，提高部门预算编制的完整性和准确性。制定印发《农业部部门预算编制工作规程》。此项任务由财务司负责落实。
二是完善“三公经费”和会议费预算制度。2011年6月-11月，按照部门预算编制要求，编制2012年“三公经费”（因公出国（境）费、公务用车购置及运行费、公务接待费）和会议费预算，其中公务接待费（含外事接待费）、公务用车运行费以及二、三类会议费原则上应通过基本支出公用经费解决。此项任务由财务司负责，会同国际合作司、办公厅落实。
三是完善国有资产管理制度。按照《农业部关于印发＜农业部部属
事业单位国有资产管理暂行办法＞等4个国有资产管理规定的通知》（农财发〔2010〕102号），督促指导部属各单位制定国有资产管理办法和国有资产管理内部审核审批流程并报部备案，规范部属单位国有资产管理，规范土地、房产、软件资产管理。此项任务由财务司负责，会同有关司局落实。
四是加强会计基础工作。2011年6月-8月，根据《
中华人民共和国会计法》、《
会计基础工作规范》和有关会计制度，以及近年来财政部和我部出台的财务管理规定，制定印发《农业部2010-2011年度会计基础工作评比方案》，指导我部行政事业单位、业务主管社会团体、部属事业单位所办企业加强会计基础工作，提高财务核算和管理的规范化水平。此项任务由财务司负责落实。
（三）强化监督，落实问责
建立健全监督检查机制，把党内监督、群众监督和行政监察监督紧密结合，增强监督的整体合力，进一步完善“小金库”违法违规行为责任追究制度。对《关于深入开展“小金库”治理工作的意见》（中办发〔2009〕18号）印发后再设立或者继续设立“小金库”的司局和单位，一律取消本年度绩效管理及其他各项评优获奖资格；对有关责任人员，一律依照《
设立“小金库”和使用“小金库”款项违法违纪行为政纪处分暂行规定》给予处理处分。此项任务分别由办公厅、驻部纪检组监察局及有关司局负责落实。
