（二）６月１６日到９月中旬，为重点检查阶段。在自查自纠的基础上，由各地区和有关部门组织力量重点对以下部门及单位实施重点检查：
１．预算外资金收支数量较大的工商行政管理、土地管理、交通、城市建设、邮电、铁路、电力、公安、司法、民政、民航、海关等部门及单位；
２．预算外资金使用、管理上问题较多的部门及单位；
３．自查不认真或拒绝自查自纠的部门及单位；
４．有群众举报的部门及单位。
各地区、各部门要尽可能多地抽调政策水平较高、业务素质较强的干部组成检查组，经过必要的培训后进点实施检查。要在本行政区域内适当选择几个地区组织开展交叉检查。财政部将会同有关部门对部份地区重点部门或重点收费、基金项目的清理检查质量进行抽查，各地区、各部门也要组织力量对下级清理检查的质量进行抽查或复查，以保证重点检查的质量和效果。
对在京中央单位和邮电、铁路、民航、海关系统的全部检查项目，以及车辆购置附加费、港口建设费、水运客货运附加费和电力建设基金（包括电力附加费）的收取、管理、使用情况，由财政部会同国家计委等有关部门组织实施重点检查。
对财政部门预算外资金的清理检查，由审计、人民银行和监察等部门组织实施，各级财政部门要积极主动地予以支持和配合。
三、清理检查的政策依据
主要是中共中央、全国人大、国务院、财政部、国家计委（包括原国家物价局）等发布的下列有关文件：
（一）１９８６年
国务院《关于加强预算外资金管理的通知》（国发［１９８６］４４号）；
（二）１９８９年财政部《关于对中央事业行政单位预算外资金全面实行财政专户储存的通知》［（８９）财综字第４１号］；
（三）１９９０年中共中央、
国务院《关于坚决制止乱收费、乱罚款和各种摊派的决定》（中发［１９９０］１６号）；
（四）１９９３年中共中央办公厅、国务院办公厅转发财政部《关于治理乱收费的规定》（中办发［１９９３］１８号）；
（五）１９９３年中共中央办公厅、国务院办公厅转发财政部《关于对行政性收费、罚没收入实行预算管理的规定》（中办发［１９９３］１９号）；
（六）１９９３年
财政部《关于进一步做好预算外资金管理工作的通知》［（９３）财综字第１５号］
