3.“固定基金”科目。
新制度未设置“固定基金”科目。转账时，应将原账中“固定基金”科目余额扣除转入新账中“固定资产清理”科目余额后的余额转入新账中“事业基金”科目。
4.“收支结余”科目。
新制度未设置“收支结余”科目，但设置了“本期结余”、“财政补助结转（余）”科目。其中，“本期结余”科目的核算内容较原账中“收支结余”科目的主要区别是不再包括财政专项补助结余。转账时，区分以下两种情况处理：
（1）对于自2011年7月1日起执行新制度的医院，应对原账中“收支结余”科目及其明细科目的余额进行分析：将原账中“收支结余--财政专项补助结余”明细科目贷方余额中属于新制度下财政项目补助结转的余额转入新账中“财政补助结转（余）--财政补助结转（项目支出结转）”明细科目，将属于新制度下财政项目补助结余的余额转入新账中“财政补助结转（余）--财政补助结余”明细科目；将原账中“收支结余--医疗收支结余、药品收支结余、其他结余”各明细科目的余额转入新账中“本期结余”科目。
（2）对于自2012年1月1日起执行新制度的医院，应对原账中“收支结余--财政专项补助结余”明细科目的贷方余额进行分析：将属于新制度下财政项目补助结转的余额转入新账中“财政补助结转（余）--财政补助结转（项目支出结转）”明细科目；将属于新制度下财政项目补助结余的余额转入新账中“财政补助结转（余）--财政补助结余”明细科目。
5.“结余分配”科目。
新制度设置了“结余分配”科目，其核算内容与原制度相应科目基本相同。原账中“结余分配”科目一般无余额，不需进行转账处理。若原账中“结余分配”科目有借方余额，应将该余额转入新账中“结余分配”科目。
原账中“结余分配--待分配结余”明细科目有贷方余额以单独反映结转下期使用的财政基本支出补助资金的，应当将该余额转入新账中“财政补助结转（余）--财政补助结转（基本支出结转）”明细科目。
（四）收入支出类。
“财政补助收入”、“上级补助收入”、“医疗收入”、“药品收入”、“其他收入”、“医疗支出”、“药品支出”、“管理费用”、“财政专项支出”、“其他支出”科目
由于原账中以上收入支出类科目月末或年末无余额，不需进行转账处理。自2011年7月1日或2012年1月1日起，应当按照新制度设置收入费用类科目并进行账务处理。
三、按照新制度对部分资产负债表项目进行追溯调整
（一）调整财政补助基本支出结转事项。
按照新制度规定，医院尚未使用的财政基本支出补助（即财政补助基本支出结转）不再提取职工福利基金和转入事业基金。医院应当将实行国库管理制度改革后已转入事业基金但尚未使用的财政基本支出补助金额转回至“财政补助结转（余）”科目。在新账中，按照实行国库管理制度改革后已转入事业基金但尚未使用的财政基本支出补助金额，借记“事业基金”科目，贷记“财政补助结转（余）--财政补助结转（基本支出结转）”科目。
（二）追溯确认待冲基金。
按照新制度规定，医院为购建固定资产、无形资产等所使用的财政补助、科教项目资金应当确认为待冲基金，并在计提资产折旧、摊销等时予以冲减。医院应当将执行新制度前所有在账固定资产（新旧转账时转入“固定资产清理”、“库存物资”科目的固定资产以及图书除外）、无形资产账面余额中由财政补助、科教项目资金形成的金额追溯确认为待冲基金。对于除房屋及建筑物、无形资产以外的确实难以追溯的固定资产，至少应当按照以下范围追溯确认待冲基金：1999年1月1日以后以固定资产入账并且执行新制度前仍在账的资产。
按照上述要求将固定资产、无形资产账面余额中由财政补助、科教项目资金形成的金额追溯确认为待冲基金时，在新账中，借记“事业基金”科目，贷记“待冲基金”科目。
（三）计提固定资产折旧。
按照新制度规定，医院应当对除图书外的固定资产计提折旧。医院应当按照新制度对执行新制度前形成的固定资产（新旧转账时转入“固定资产清理”、“库存物资”科目的固定资产以及图书除外）计提折旧，并将计提的折旧冲减待冲基金和事业基金。在新账中，按照应计提的折旧金额中应冲减待冲基金的部分，借记“待冲基金”科目，按照应计提的折旧金额中的剩余部分，借记“事业基金”科目，按照应计提的折旧金额，贷记“累计折旧”科目。
