加强卫生应急能力建设。强化市、县卫生部门和疾控、卫生监督机构及二级以上医疗机构应急管理能力建设，推进卫生应急示范区建设，加强卫生应急规范化管理。完善信息报送、风险评估和监测预警制度，加强突发公共卫生事件早期预警工作。建立健全网络实验室运行机制，强化卫生应急检验检测能力建设。启动全国紧急医学救援基地建设工作，加强国家鼠疫演练基地和菌种保藏中心建设，健全卫生应急物资储备、调拨机制，加强卫生应急队伍建设，改善队伍装备与保障条件，加大培训演练力度，提高现场处置能力。加强重大突发公共卫生事件预防控制，积极开展重大灾害事故紧急医学救援，做好重大活动卫生保障工作。
做好重大疾病防控工作。有效控制鼠疫、霍乱、人感染高致病性禽流感、传染性非典型肺炎等突发急性传染病的发生蔓延，加大流感、手足口病、狂犬病等重点传染病防控力度，及时有效处置传染病暴发疫情。进一步落实艾滋病、性病和丙型肝炎综合防治措施，稳步推行结核病防治“三位一体”的新型服务模式。保持我国无脊灰状态，继续做好国家免疫规划常规免疫和消除麻疹工作，加强疫苗管理，开展全国性专项联合督导检查。继续实施以控制传染源为主的血防综合治理项目和全国消除疟疾行动计划。巩固地方病防治成果，推进消除麻风病危害和重点地方病危害的进程。全面加强慢性病预防控制工作。加快推进精神卫生防治体系建设，健全全国重性精神疾病防治工作网络，提高患者管理率和治疗率。实施“全国儿童口腔疾病综合干预行动计划”，推广口腔疾病预防适宜技术。
完善公共卫生服务体系建设。不断完善疾病预防控制体系建设，推动机构编制标准和管理规定的颁布实施。全面推进绩效考核，建立疾病预防控制医师制度和岗位责任制，实施疾病预防控制能力建设，提高基层防控能力。扎实推进“全国城乡环境卫生整洁行动”和以改水改厕为重点的农村环境整治活动，进一步做好卫生城市和健康城市创建工作，深入开展爱国卫生工作。
加强妇幼保健和健康教育工作。贯彻落实《
母婴保健法》，制定完善配套规章和技术规范。贯彻《
中国儿童发展纲要（2011-2020年）》和《
中国妇女发展纲要（2011-2020年）》，制定实施方案。开展县级妇幼卫生工作绩效考核。制定妇幼保健机构建设标准，修订机构评审办法。继续做好“降消”等项目。加强爱婴医院管理，开展爱婴医院复核。倡导促进自然分娩和母乳喂养，降低剖宫产率。通过加强婚前孕前检查、孕期保健、产前诊断、新生儿疾病筛查工作，努力减少新生儿出生缺陷。加强对妇女常见病防治工作的管理和规范，开展儿童营养与健康监测试点。探索建立全国居民健康素养监测体系。加大卫生系统、学校控烟力度，推动全国控烟工作。
