49.
农业基本建设项目竣工验收管理规定（2004年7月14日农计发[2004]10号）
50.
农业建设项目监督检查规定（2004年7月14日农计发[2004]10号）
51.农业建设项目检查工作细则（试行）（2005年12月7日农办计[2005]86号）
52.农业建设项目违规处理办法（试行）（2006年4月14日农计发[2006]9号）
53.农业建设项目举报处理暂行规定（2008年5月28日农计发[2008]12号）
54.农业建设项目招标检查工作规定（2008年11月19日农计发[2008]26号）
55.农业部关于印发《
神农中华农业科技奖奖励办法（试行）》的通知（2006年10月12日农科教发[2006]6号）
56.
农业部公告第736号（农业转基因生物安全证书续申请简化程序规定）（2006年10月27日公布）
57.
农业部公告第822号（南繁的转基因农作物安全评价申报要求）（2007年3月2日公布）
58.
农业部公告第989号（转基因抗虫棉生产应用安全证书申请简化程序规定）（2008年2月25日公布）
59.农业部关于印发《
全国农牧渔业丰收奖奖励办法》的通知（2010年9月14日农科教发[2010]3号）
60.农业部办公厅关于印发《“十二五”农业部引进国际先进农业科学技术（948计划）项目管理办法》的通知（2010年8月23日农办科[2010]70号）
61.农业部公告第72号（
中华人民共和国进境植物检疫禁止进境物名录）（1997年12月29日公布）
62.农业部公告第154号（对椰心叶甲采取检疫措施）（2001年3月26日公布）
63.
农业部公告第453号（将红火蚁确定为中华人民共和国进境植物检疫性有害生物和全国农业植物检疫性有害生物）（2005年1月17日公布）
64.
农业部、国家林业局、国家质量监督检验检疫总局公告第538号（将刺桐姬小蜂确定为中华人民共和国进境植物检疫性有害生物和全国林业检疫性有害生物以及暂停从疫区国家和地区引进刺桐属植物）（2005年8月29日公布）
65.
农业部公告第862号（中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录）（2007年5月29日公布）
66.
农业部、国家质量监督检验检疫总局公告第1147号（将扶桑绵粉蚧列入《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录》）（2009年2月3日公布）
67.农业部公告第1216号（全国农业植物检疫性有害生物名单、应施检疫的植物及植物产品名单）（2009年6月4日公布）
68.农业部、国家林业局公告第1380号（将扶桑绵粉蚧列为全国农业、林业检疫性有害生物）（2010年5月5日公布）
69.农业部、海关总署关于《对外国农药试验实行免税放行办法》的通知（1988年6月2日[88]农（农）字第16号）
70.
农业部关于《调整国外农药试验收费标准》的通知（1990年9月19日[90]农（计）字第61号）
71.农业部关于禁止在茶树上使用三氯杀螨醇的通知（1997年6月20日农农发[1997]11号）
72.农业部、化学工业部、全国供销合作总社关于停止生产、销售、使用除草醚农药的通知（1997年10月30日农农发[1997]17号）
73.农业部、
海关总署关于对进出口农药实施登记证明管理的通知（1999年6月9日农农发[1999]9号）
74.农业部关于禁止在茶树上使用氰戊菊酯的通知（1999年11月24日农农发[1999]20号）
75.农药登记药效试验单位认证管理办法（2001年12月10日农农发[2001]25号）
76.
农业部公告第194号（停止受理克百威等高毒农药登记，停止批准高毒剧毒农药分装登记，撤销氧乐果在甘蓝上的登记）（2002年4月22日公布）
77.农业部公告第199号（公布六六六等国家明令禁止使用的农药和不得在蔬菜、果树、茶叶、中草药材上使用的高毒农药）（2002年5月24日公布）
78.农业部关于印发《
农药登记残留试验单位认证管理办法》的通知（2002年6月19日农农发[2002]10号）
79.
农业部公告第274号（撤销甲胺磷等5种高毒农药混配制剂登记，撤销丁酰肼在花生上的登记，强化杀鼠剂的管理）（2003年4月30日公布）
80.农业部、公安部、国家发展和改革委员会、卫生部、国家工商行政管理总局、国家质量监督检验检疫总局、国家环境保护总局、国家食品药品监督管理局、
国家安全生产监督管理局《关于清查收缴毒鼠强等禁用剧毒杀鼠剂的通告》（2003年7月18日公布）
81.农业部、国家工商行政管理总局、国家安全生产监督管理局、
全国爱国卫生运动委员会《关于开展杀鼠剂经营资格核准工作的通知》（2003年8月1日农农发[2003]14号）
82.农业部、国家工商行政管理总局、国家安全生产监督管理局、
全国爱国卫生运动委员会《关于开展杀鼠剂经营资格核准工作的补充通知》（2003年10月8日农农发[2003]17号）
