四十二、第六十八条改为第九十八条，增加一款，作为第二款：“询问不满十八岁的证人，可以通知其法定代理人到场。”
四十三、第七十三条改为第一百零三条，修改为：“侦查人员执行勘验、检查，必须持有人民检察院或者公安机关的证明文件。”
四十四、第八十条改为第一百一十条，修改为：“任何单位和个人，有义务按照人民检察院和公安机关的要求，交出可以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的物证、书证、视听资料。”
四十五、第八十六条后增加一条，作为第一百一十七条：“人民检察院、公安机关根据侦查犯罪的需要，可以依照规定查询、冻结犯罪嫌疑人的存款、汇款。
“犯罪嫌疑人的存款、汇款已被冻结的，不得重复冻结。”
四十六、第八十七条改为第一百一十八条，修改为：“对于扣押的物品、文件、邮件、电报或者冻结的存款、汇款，经查明确实与案件无关的，应当在三日以内解除扣押、冻结，退还原主或者原邮电机关。”
四十七、第八十九条改为第一百二十条，增加二款，作为第二款、第三款：
“对人身伤害的医学鉴定有争议需要重新鉴定或者对精神病的医学鉴定，由省级人民政府指定的医院进行。鉴定人进行鉴定后，应当写出鉴定结论，并且由鉴定人签名，医院加盖公章。
“鉴定人故意作虚假鉴定的，应当承担法律责任。”
四十八、第九十条改为第一百二十一条，修改为：“侦查机关应当将用作证据的鉴定结论告知犯罪嫌疑人、被害人。如果犯罪嫌疑人、被害人提出申请，可以补充鉴定或者重新鉴定。”
四十九、第九十二条后增加一条，作为第一百二十二条：“对犯罪嫌疑人作精神病鉴定的期间不计入办案期限。”
五十、第九十条改为二条，作为第一百二十四条、第一百二十五条，修改为：
１、“第一百二十四条 对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级人民检察院批准延长一个月。”
２、“第一百二十五条 因为特殊原因，在较长时间内不宜交付审判的特别重大复杂的案件，由最高人民检察院报请全国人民代表大会常务委员会批准延期审理。”
五十一、第九十三条前增加三条，作为第一百二十六条、第一百二十七条、第一百二十八条：
１、“第一百二十六条 下列案件在本法第一百二十四条规定的期限届满不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以延长二个月：
“（一）交通十分不便的边远地区的重大复杂案件；
“（二）重大的犯罪集团案件；
“（三）流窜作案的重大复杂案件；
“（四）犯罪涉及面广，取证困难的重大复杂案件。”
２、“第一百二十七条 对犯罪嫌疑人可能判处十年有期徒刑以上刑罚，依照本法第一百二十六条规定延长期限届满，仍不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以再延长二个月。”
３、“第一百二十八条 在侦查期间，发现犯罪嫌疑人另有重要罪行的，自发现之日起依照本法第一百二十四条的规定重新计算侦查羁押期限。
“犯罪嫌疑人不讲真实姓名、住址，身份不明的，侦查羁押期限自查清其身份之日起计算，但是不得停止对其犯罪行为的侦查取证。对于犯罪事实清楚，证据确实、充分的，也可以按其自报的姓名移送人民检察院审查起诉。”
五十二、第九十三条改为第一百二十九条，修改为：“公安机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定。”
五十三、第二编第二章第八节后增加一节，作为第十节：
“第十节 人民检察院对直接受理的案件的侦查”
“第一百三十一条 人民检察院对直接受理的案件的侦查适用本章规定。”
“第一百三十二条 人民检察院直接受理的案件中符合本法第六十条、第六十一条第四项、第五项规定情形，需要逮捕、拘留犯罪嫌疑人的，由人民检察院作出决定，由公安机关执行。”
“第一百三十三条 人民检察院对直接受理的案件中被拘留的人，应当在拘留后的二十四小时以内进行讯问。在发现不应当拘留的时候，必须立即释放，发给释放证明。对需要逮捕而证据还不充足的，可以取保候审或者监视居住。”
“第一百三十四条 人民检察院对直接受理的案件中被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在十日以内作出决定。在特殊情况下，决定逮捕的时间可以延长一日至四日。对不需要逮捕的，应当立即释放；对于需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。”
“第一百三十五条 人民检察院侦查终结的案件，应当作出提起公诉、不起诉或者撤销案件的决定。”
