18.农业部农业微生物资源利用重点实验室：主要开展农业微生物资源收集、保藏、鉴定、利用评价，生物防治、环保、食品和饲料用、转基因生物用、农业蛋白质工程用微生物遗传改良、微生物代谢物的农业利用等研究。
19.农业部农业环境重点实验室：重点开展在全球气候变化背景下，气候变化与农业相互作用机理，主要农业气象灾害发生规律及调控，农业环境保护、监测与预警，污染与退化农田生态系统修复，农业活动对环境的作用机理及调控等研究。
20. 农业部植物营养与肥料重点实验室：主要开展植物营养生理学、生态学基础，作物养分循环、转化过程及调控机理，养分资源高效利用与现代技术基础高效施肥技术，新型肥料研制和应用等研究。
21. 农业部耕地保育重点实验室：主要开展耕地质量演变规律、影响因素及作用机制，中低产耕地改良及高产耕地保育的理论、技术及材料，耕地养分及水土流失防控技术、耕地资源管理等研究。
22.农业部作物高效用水重点实验室：主要开展农业水资源配置、高效转化与利用机制，主要作物水分高效利用的生物学基础，作物抗旱节水、耐渍耐涝的遗传改良、生理调控，节水农作制度的理论与方法等研究。
23.农业部农村可再生能源开发利用重点实验室：以农村新型绿色能源的开发利用为重点，开展以能源植物的评价与利用，作物秸秆、畜禽粪便等农业副产物能源化利用，生物质高效转化技术和新工艺等研究。
24.农业部动物营养与饲料学重点实验室：主要开展动物营养需要、代谢机理，营养与免疫，饲料高效利用与新型饲料研制、健康养殖环境控制、排泄物无害化机理及产品安全，动物营养与代谢病等方面研究。
25.农业部作物生理生态与耕作重点实验室：主要开展作物生长发育规律及分子生理，高产、优质、高效、安全栽培理论与技术，农田生态系统及其对环境适应的机制，作物耕作技术和高效农作制理论等研究。
26. 农业部农产品质量安全重点实验室：主要开展农产品质量安全风险评估与预警，农产品质量安全检测技术与标准，农产品真假识别与污染物溯源，农产品质量安全源头治理及种养殖过程控制等理论与技术研究。
27.农业部农产品加工重点实验室：主要开展农产品保鲜贮运，综合利用、精深加工，功能食品及添加剂、食源性微生物，以及农产品加工新技术、新工艺及设备等研究与开发。
28. 农业部现代农业装备重点实验室：主要开展农业机械化技术基础与关键部件，种养殖业重要环节的机械化技术与装备，农机性能质量评价与安全监定技术等研究。
29.农业部农业信息技术重点实验室：以知识为基础，代替人工进行农业智能管理与决策系统为目标，研制开发新型农业信息系统平台；采用3S技术，建立政策、市场、资源、技术等综合信息网络体系；加大数字农业、精确农业、虚拟农业、智能专家系统等开发力度，建立方便快捷的综合性的监测、预警、安全系统，实现多种网络（计算机、电视、卫星通讯和电话网络）融合，全方位的为发展现代农业提供技术支撑。
30.农业部设施农业工程重点实验室：主要开展温室大棚等工厂化设施新材料开发、结构设计创新与建设标准，设施内部环境控制技术与装备、设施作物高产优质高效栽培与自动化管理、设施内部小型作业机械等研制，以及设施标准化养殖、设施种养殖业废弃物无害化处理技术与装备等研究。
（二）专业性（区域性）重点实验室与科学观测实验站建设布局
