要加强对口岸查验人员的教育，进一步树立为货主、为旅客服务的思想，增强服务意识，秉公执法，礼貌待人。要加强制度和纪律建设，严防以权谋私，对违法违纪人员要依法严处。
（七）改革口岸行政管理机构。
将深圳市口岸办公室改为深圳市口岸管理委员会，进入政府序列，由市政府一位主要负责人兼任口岸管委会主任。口岸管委会的主要职责是：加强口岸综合管理，规划、管理口岸查验基础设施，搞好服务；协调各口岸查验单位工作关系，及时解决口岸出现的矛盾和问题；监督、检查口岸查验单位的执法情况；处理好中央驻深圳查验单位与当地的关系等。
深圳市港口实行政企分开的管理体制，深圳市港务管理部门是深圳市政府主管港口行政工作的职能部门，要与港埠装卸企业脱钩，进入政府序列，人员按照公务员进行管理，在业务上接受交通部、省交通主管部门的指导。其主要职责是：贯彻执行交通法规；负责深圳港口区域的规划、建设、改造、维护和岸线管理；负责港埠企业、货主码头的管理；负责搞好港口的治安、消防和环保工作；监督国家指令性任务的执行。
（八）改革港监管理体制。
改变深圳港监与蛇口港监“一水两监”的局面。参照国际通行做法，按照港监管理要统一政令，我国沿海等重要水域由中央按水域划区设置机构管理的原则，地方在深圳水域设置的港监机构，要与交通部在深圳设置的海上安全监督机构合并，实行交通部与深圳市人民政府双重领导，以交通部为主的管理体制。
撤销大铲岛中途检查站，海关采取其他措施加强缉私工作。
（九）改革引航管理体制。
可以组建独立的国有独资公司或社团法人承担引航服务。对外国籍船舶，要进行强制引航。交通部实行行业管理。
（十）港埠装卸企业要积极推行建立现代企业制度的改革。
根据政企分开的原则，港埠装卸企业要按照建立社会主义市场经济体制的要求，深化企业改革，转换机制、依法经营，真正成为法人实体和市场运行主体。
（十一）逐步放开对外服务市场。
要放开外轮代理、外轮供应、理货和货运代理等服务市场。按照国家规定，可以设立若干家服务机构开展上述服务。
外轮代理、外轮供应、理货和货运代理等服务机构的收费应由物价管理部门会同行业主管部门制定价格管理办法，收费标准逐步由市场调节。
四、改革的具体步骤
整个改革可分为三个阶段：
