| 序号 | 模块 | 比例 | 一级问题 | 比例 | 二级问题 | 比例 | 说明及参考评分标准 |
| 1 | 项目定位 | 15% | 项目绩效目标是否明确 | 30% | 项目是否有结果导向、具体明确的绩效目标和指标 | 50% | 项目目标具体明确的81～100分，一般的61～80分，不具体明确的0～60分。 |
| 2 | 项目年度目标的实现是否存在一定难度或挑战性 | 50% | 项目实现目标存在一定难度或挑战的61～100分，一般的0～60分。 |
| 3 | 项目承担单位选择是否合适 | 30% | 项目承担单位是否具备承担相应种质资源保护和利用工作的基础设施条件 | 50% | 项目承担单位具备基础设施条件的81～100分，基本具备的61～80分，不具备的0～60分。 |
| 4 | 项目团队是否具有实现项目目标的技术方法和技术路线 | 50% | 项目团队具备种质资源保护和利用相关技术力量的81～100分，基本具备的61～80分，不具备的0～60分。 |
| 5 | 项目是否避免了与其他项目的重复 | 20% | 项目是否与已实施、在实施的本专项项目不重复 | 50% | 本项目与已实施、在实施的本专项项目不重复的100分，有重复的酌情扣分。 |
| 6 | 项目是否与其他专项及横向项目不重复 | 50% | 本项目与农业部等部门安排的、通过市场运行的及地方安排的横向项目不重复的100分，有重复的酌情扣分。 |
| 7 | 项目是否有明确的服务对象或受益人 | 20% | 项目能否满足服务对象或受益人的需求 | 50% | 本项目满足育种、生产、生态等服务对象或受益人的需求属急需的81～100分，一般的61～80分，不明确的0～60分。 |
| 8 | 项目服务对象或受益人的受益面（地区、单位、学科）是否广泛 | 50% | 在有关地区、或相关单位、或相关学科范围内，本项目受益面广泛的81～100分，一般的61～80分，不广泛的0～60分。 |
| 序号 | 模块 | 比例 | 一级问题 | 比例 | 二级问题 | 比例 | 说明及参考评分标准 |
| 9 | 项目计划 | 15% | 项目是否有明确的实施计划 | 50% | 项目的责任主体是否明确，项目所需配备的科研人员和辅助人员是否落实 | 34% | 项目责任主体明确、人员落实的81～100分，一般的61～80分，不明确、不落实的0～60分。 |
| 10 | 项目绩效目标的实现是否有明确的时间要求 | 33% | 项目有明确时间进度要求的81～100分，时间进度要求模糊的61～80分，不明确的0～60分。 |
| 11 | 项目设计是否有保证和改进绩效指标质量的关键措施和责任 | 33% | 项目有明确质量要求的81～100分，质量要求模糊的61～80分，无质量要求的0～60分。 |
| 12 | 项目的预算安排是否合理 | 50% | 项目测算支出标准是否合理 | 25% | 项目预算编制时，支出标准测算合理的81～100分，一般的61～80分，不合理的0～60分 |
| 13 | 项目主管部门和财政部门是否按计划及时拨付资金 | 25% | 项目主管部门和财政部门及时拨付资金的81～100分，不及时的1～80分，未拨付的0分。 |
| 14 | 项目资金使用情况是否及时、准确的向主管部门和财政部门报告 | 25% | 项目单位及时准确报告的81～100分，不及时的1～80分，不报告的0分。 |
| 15 | 项目资金使用是否与预算批复相符，如有调整是否符合有关预算管理规定 | 25% | 项目资金使用与预算相符或调整符合规定的81～100分，部分符合的61～80分，不符合或挪作他用的0～60分。 |
| 16 | 项目管理 | 30% | 项目管理者与参与者工作是否到位 | 50% | 项目承担单位的领导是否重视本项目的管理 | 34% | 领导重视包括项目人员配备、后备力量培养、财力支持、考核机制倾斜等方面。重视的81～100分，一般的61～80分，不重视的0～60分。 |
| 17 | 项目负责人是否把精力集中于本项目的管理和技术把关 | 33% | 项目负责人投入工作量多的81～100分，一般的61～80分，少的0～60分。 |
| 18 | 项目组织管理是否规范、严格，效果和作用是否明显 | 33% | 项目组织管理规范、严格，效果和作用明显的，81～100分，管理一般的61～80分，较差的0～60分。 |
| 19 | 项目财务管理是否规范 | 50% | 项目是否有健全的财务管理制度和人员进行财务管理 | 34% | 项目财务管理制度健全并有专人管理的81～100分，管理一般的61～80分，较差的0～60分。 |
| 20 | 项目财务会计管理是否规范合理 | 33% | 项目建立专账、专款专用、规范合理的81～100分，有问题的酌情扣分，违规现象较多且严重的0分。 |
| 21 | 项目资金支出是否出现违规现象 | 33% | 项目资金支出无违规现象的100分，有问题的酌情扣分的，违规现象较多且严重的0分。 |
| 序号 | 模块 | 比例 | 一级问题 | 比例 | 二级问题 | 比例 | 说明及参考评分标准 |
| 22 | 项目结果 | 40% | 项目是否实现了年度绩效目标 | 30% | 项目是否按时完成了年度计划的各项工作内容 | 50% | 完成年度工作内容的81～100分，基本完成的61～80分，完成情况不好的0～60分。 |
| 23 | 项目完成的各项工作内容及成果是否符合质量要求 | 50% | 年度工作内容符合质量要求的81～100分，一般的61～80分，较差的0～60分。 |
| 24 | 项目是否实现了长期绩效目标 | 30% | 近年来项目是否对我国种质资源的收集与保护发挥了重要作用或作出重要贡献 | 50% | 本问题所指作用和贡献是指项目在国内重要物种和遗传资源抢救性收集、保存、保护及国外重要种质资源收集、引进上所作出的贡献，不仅限于本年度项目，还包括近年来本专项的作用和贡献。作用显著或贡献大的81～100分，一般的61～80分，较差的0～60分。 |
| 25 | 项目的年度目标与国家对种质资源保护和利用长期战略目标的实现是否匹配 | 50% | 项目年度工作任务与国家在国内重要物种和遗传资源抢救性收集、保存、保护及国外重要种质资源收集、引进等方面的长期战略目标匹配的81～100分，一般的61～80分，不匹配的0～60分。 |
| 26 | 项目是否实现了效率绩效目标 | 40% | 项目执行是否体现节约成本、提高效率的原则 | 34% | 项目在执行过程中节约成本，减少浪费的措施到位的81～100分，一般的61～80分，较差的0～60分。 |
| 27 | 近年来项目分发的种质资源是否已被育种和生产直接利用形成效益 | 33% | 本问题所指效益是指利用种质资源育成新品种情况、被生产直接利用情况、发表论文和著作情况、获奖情况等，不仅限于本年度项目，还包括近年来本专项产生的效益。效益显著的81～100分，一般的61～80分，较差的0～60分。 |
| 28 | 近年来项目分发的种质资源是否已被环境、生态及其他研究领域利用并取得效益或重要进展 | 33% | 本问题所指效益主要是指种质资源被环境、生态及其他研究领域利用情况、发表论文和著作情况、获奖情况等，不仅限于本年度项目，还包括近年来本专项产生的效益。效益显著的81～100分，一般的61～80分，较差的0～60分。 |
