第八条 拟组织重点项目的研究领域需提交学科评审组讨论审议，由委务会审查批准，通过“国家自然科学基金重点项目申请指南”向科学界发布。重点项目申请指南包括研究领域、主要研究方向、预算的经费数额及受理的科学部等内容。
第九条 符合重点项目申请条件的在职科技人员可根据当年申请指南，向对口科学部提出申请。项目申请者及具有高级专业技术职称参与申请的其他成员每次只能参加一个重点项目的申请。在研重大、重点项目的项目主持人、课题负责人及具有高级专业技术职称的主要成员需在该项目验收结题后方可申请新的重点项目。
第十条 各科学部将申请书初筛后按项目汇总送同行专家评议，评议专家应对每个申请填写“国家自然科学基金重点项目同行评议意见”，对一个项目的全部申请填写“国家自然科学基金重点项目同行评议综合意见”，每项申请的有效同行评议意见应不少于５份。
第十一条 科学部对同行评议意见分析、归纳后连同全部申请书、同行评议材料提交学科评审组评审。根据需要可邀请少数同行评议专家参加评审，也可安排申请者到会答辩，确有必要时还可以组织专项评审论证。
第十二条 每个重点项目的评审都应选出最优申请予以资助，一般不宜将几份申请组织成一个项目，在条件相近时，利用国家重点实验室的申请予以优先支持。评审结束后应填写“国家自然科学基金重点项目评审意见”。
第十三条 “国家自然科学基金重点项目评审意见”经科学部签署意见。连同当年度重点项目资助计划提交委务会议审批，根据审批结果向项目负责人及其所在单位下达《国家自然科学基金重点项目批准通知》。
第三章 计划实施与管理
第十四条 科学基金委员会对重点项目采取逐项跟踪、中期检查、结题验收等办法加强管理。
重点项目的承担单位应将项目列入本单位的重点科研计划，提供实施计划所需的工作条件，确保研究计划的完成。
第十五条 项目负责人接到批准通知后一具月内，应在申请书基础上，根据审批意见，填写《国家自然科学基金资助项目研究计划》（一式三份）报主管科学部核准后作为拨款、检查和验收的依据，科学部须将该研究计划和申请书各一份转综合计划局（以下简称计划局）备案。
