第七条 组织间协议对组织间合作研究项目管理有特殊约定的，从其约定。
第二章 申请与受理
第八条 自然科学基金委应当根据基金发展规划、国际（地区）合作政策和基金资助工作评估报告制定合作研究项目年度项目指南。
年度项目指南应当体现优先发展领域、学科发展战略，明确鼓励的研究领域或者研究方向。
第九条 自然科学基金委制定合作研究项目年度项目指南应当广泛听取意见、组织专家进行论证。年度项目指南应当在受理项目申请起始之日30日前公布。
第十条 依托单位的科学技术人员具备下列条件的，可以申请合作研究项目：
（一）具有高级专业技术职务（职称）；
（二）作为项目负责人正在承担或者承担过3年期以上科学基金资助项目；
（三）与国外（地区）合作者具有良好的合作基础。
第十一条 申请合作研究项目的数量应当符合下列要求：
（一）具有高级专业技术职务（职称）的人员，同年申请或者参与申请合作研究项目不得超过1项；
（二）正在承担合作研究项目的负责人和具有高级专业技术职务（职称）的参与者不得申请或者参与申请；
（三）年度项目指南中对申请数量的限制。
第十二条 申请人应当是申请合作研究项目的实际负责人，限为1人。
参与者与申请人不是同一单位的，参与者所在单位视为国内合作研究单位，国内合作研究单位的数量不得超过2个。
合作研究项目的研究期限一般为3年。
第十三条 合作研究项目申请人应当提供与国外（地区）合作者签订的合作研究协议书。
合作研究协议书应当包括：
（一）合作研究内容和所要达到的研究目标；
（二）合作双方负责人和主要参与者；
（三）合作研究的期限、方式和计划；
（四）知识产权的归属、使用和转移；
