1、1982年，国务院机构改革。农业部、农垦部、国家水产总局合并，设置农牧渔业部。
2、1988年，国务院进行机构改革。农牧渔业部的职能需要扩大，并照顾到国内外的习惯叫法，农牧渔业部更名为农业部。
1988年4月—1993年3月 中华人民共和国农业部
机构名称：农业部
设置时间：1988年
依据：《
国务院机构改革方案》（1988）
主要职能：农业部是国务院综合管理种植业、畜牧业、水产业、农垦、乡镇企业和饲料工业等产业的职能部门，又是农村经济宏观管理的协调部门。
说明：农牧渔业部更名为农业部。
1993年3月—1998年3月 中华人民共和国农业部
机构名称：农业部
设置时间：1993年
依据：《
国务院机构改革方案》（1993）
说明：国务院机构改革，保留农业部。农业部机构改革的指导思想是：按照建立社会主义市场经济体制的要求，把工作重点转到加强对农村经济的“引导、支持、保护、调控”上来，改革旧的管理体制和工作方式，理顺农业系统的内、外部关系，实行政事、政企职责分开，转变职能，精兵简政，提高效率，促进农业生产持续稳定发展。
1998年3月— 中华人民共和国农业部
机构名称：农业部
设置时间：1998年
依据：《
国务院机构改革方案》（1998）和《
国务院关于机构设置的通知》（国发[1998]5号）、《
国务院关于机构设置的通知》（国发[2003]8号）、《
国务院关于机构设置的通知》（国发[2008]11号）
主要职能：综合管理种植业、畜牧业、水产业、农垦、乡镇企业和饲料工业等产业，协调农村经济宏观管理，其具体职能为：
1、研究拟定农业和农村经济发展战略、中长期发展规划，经批准后组织实施；拟定农业开发规划并监督实施；
2、研究拟定农业的产业政策，引导农业产业结构的合理调整、农业资源的合理配置和产品品质的改善；提出有关农产品及农业生产资料价格、关税调整、大宗农产品流通、农村信贷、税收及农业财政补贴的政策建议；组织起草种植业、畜牧业、渔业、乡镇企业等农业各产业（以下简称农业各产业）的法律、法规草案；
3、研究提出深化农村经济体制改革的意见；指导农业社会化服务体系建设和乡村集体经济组织、合作经济组织建设；按照中央要求，稳定和完善农村基本经营制度、政策，调节农村经济利益关系，指导、监督减轻农民负担和耕地使用权流转工作；
