即使在侦查阶段，破案的效率虽应高度重视，但这也不意味着可以忽略对公正的要求。曾经发生的冤错案表明，正是在侦查阶段，由于及时破案等效率方面的考虑而忽视办案质量，导致在实体上形成冤错案，在程序中违法，甚至严重侵犯权益，使司法公正受到严重损害。当然，冤错案的发生使刑事诉讼中的公正和效率同时受损，但这与片面强调效率不无关系。在这个意义上，在我国现阶段，尤其应强调侦查阶段严格遵守法定程序的要求，公正办案。
从历史的角度分析，刑事诉讼的发展趋势表明，刑事诉讼经历了从野蛮到文明、从愚昧到科学、从恣意到规范的过程，直到今天，这个过程仍未完成。因此，我国刑事诉讼法的修改，是促进我国刑事诉讼的进一步科学、文明、规范的一个重要努力。就此而言，修改后的刑事诉讼法，对刑事辩护制度、证据制度、强制措施制度以及侦查、起诉和审判、执行等许多程序予以进一步完善，有助于保障和促进刑事诉讼中的公正。例如，修改后的刑事诉讼法设置了比较完整的非法证据排除制度，这虽然使刑事诉讼的程序更加复杂了，但由此使刑事诉讼的公正得到进一步的保障，因此，我们应严格遵守相关程序的要求，绝不能因为会对诉讼效率有“不利影响”，以公正与效率“并重”、“兼顾”为由，为了所谓的效率的需要而拒不执行相关程序的规范要求。
如果说刑事诉讼中的公正是效率的基础，那么，解决效率问题应当为着实现公正这个基本目标，因此，刑事诉讼中的公正，包括实体公正和程序公正，是我们首先需要关注的重点。其中，程序公正即刑事诉讼在实现发现、揭露、证实和惩罚犯罪的过程中，依据公正的刑事司法程序进行，具有基础性的地位。
在现代刑事诉讼中，缺乏这一基础，实体公正将无所依凭，刑事诉讼的效率也就无从谈起。因此，我国刑事诉讼中的公正和效率这个现实问题的进一步解决，首先是设置完备而公正的程序;而在刑事诉讼法修改之后，则是在司法实践中严格贯彻落实程序的规范要求，以在保障权利、限制司法恣意、促进文明、科学办案的基础上实现刑事诉讼的公正与效率的要求。
当然，对刑事诉讼中的公正与效率及其关系问题，我们对其的认识不应仅限于法律规定的层面，而应在实践中予以进一步深化。
