由于财务软件的开发未能实行统一的标准，再加之单位使用的财务软件是各自向软件开发商购买的，甚至有的软件开发商还别出心裁地搞出各自的特色，结果使会计电算化所用财务软件比较混乱，就是同一行业的不同单位使用的财务软件也不尽相同。不同的财务软件的数据接口、使用方法的不一样，导致了报表汇总、数据查询、数据传输的不方便。
三、推进会计电算化的对策
（一）提高对会计电算化的认识
从已实施会计电算化工作的企业来看主要有以下认识偏差：
一是认为会计电算化只是会计核算工具的改变，甚至有的认为会计电算化只是用计算机代替人工，打出的帐比手工记的帐好看一些，搞不搞无所谓，看不到其对会计职能、企业管理方法和管理流程的深刻影响，因此对会计电算化工作一味求简；
二是许多企业领导对会计电算化存在片面认识，仅把会计电算化认为素，把财会是企业现代化管理的标志，当作树立企业形象的一种手段，把计算机作为主要因人员作为次要因素，只重视机的因素，不重视人的因素，不重视人员的培训；
三是部分财务人员错误地认为实行会计电算化只是一个形式，较为方便，没有意识到实现会计电算化的重大意义，在实际操作中对于会计软件的使用只局限在核算上，对于其他作用、功能不加以使用推行，以至于有些单位花钱买了软件却没有真正使用。
我们所定义的会计电算化，是电子计算机在会计工作中应用的简称，是以电子计算机为主的现代电子信息技术应用到会计中，用电子计算机代替人工记账、算报账，以及部分替代人工完工对信息的分析、预测、决策的过程，以提高财会管理水平和经济效益，进而实现会计工作的现代化。单位领导以及会计人员要加强对会计电算化的认识，转变观念，既要重视机的因素，也要重视人的因素，要意识到实现会计电算化不仅是核算工具和核算方法的改进，而且对于会计学科本身也是一次大的革命，这种“革命”可以使会计人员从繁琐的记帐、算帐、报帐中解脱出来，将更多的时间和精力用于资金管理、资金分析上，为科学决策提供可靠的分析数据，从而促进单位经济业务的发展，提高整个会计工作水平。
（二）进一步完善会计电算化的配套法规
随着会计电算化的普及与财务软件功能的不断增加，针对会计电算化工作出现的新问题，需要对现有的相关法规进一步补充和完善，通过准则类法规对会计电算化进一步约束，使会计电算化工作走上规范化的道路。另外，需细化对商品化软件的评审规定，杜绝软件的非法功能。
