值得注意的是，辩诉交易的机理一般是被告人向法官作出有罪答辩，以换取检察官撤销指控或降格指控或检察官法官请求从轻处理，因此，一旦被告同意交易，则意味着被告将放弃无罪答辩，在许多情况下也意味着放弃了公开审判的权利。这是被告人对自身实体权利的处分，也是对程序权利进行选择的结果。
2.刑事诉讼中关于程序问题的合意
刑事诉讼中关于程序问题的合意种类随着当事人程序权利的扩张在逐步增多，如适用诉讼程序上的合意、证据问题的合意等，都是在程序文明的发展过程中逐步出现和合法化的。
（1）适用程序上的合意
鉴于诉讼实践中普遍存在的公正与效率冲突问题，许多国家都在制度精细、完整的普通程序的基础上增设了简约、快捷的各种简单程序（注：根据《布莱克法律词典》的解释，简易程序仅相对于普通程序（Ordinary Proceeding）而言，泛指不经检察官起诉、陪审团定罪或者普通法正常程序所要求的其他程序，法官直接以迅速、简单的方式处理争议、解决案件，作出裁判的任何诉讼程序。因此，国外的简易程序这一概念包括的范围相当广。参见王国枢、项振华：中外刑事诉讼简易程序比较[J]。中外法学，1999,3。），以增加诉讼机制对复杂的司法实践适应能力。如美国，普通程序以外的简易程序有两种：司法官审理轻微犯罪程序和辩诉交易程序。司法官审理轻微犯罪程序，是指对于《美国法典》规定的轻罪、微罪案件以及此类案件的申诉案件，经被告人的书面同意，由司法官或者地区法院法官进行简单审理并立即裁判的简易程序。而德国刑事诉讼法典规定的五种特别种类程序中，至少有三种程序是符合《布莱克法律词典》所定义的简易程序。（注：德国刑诉法中规定了三类程序：普通程序、被害人参加程序和特别种类程序。特别种类程序包括：处罚令程序，保安处分程序，简易程序，没收、扣押财产程序，对法人、社会团体处以罚款程序五种。参见王国枢、项振华：中外刑事诉讼简易程序比较[J]。中外法学，1999,3。）意大利刑事诉讼法中除了规定正式的审判程序外，部分案件也可以进入特别审判程序。（注：意大利的特别程序分别为：简易审判程序，依当事人的要求适用刑罚程序，快速审判程序，立即审判和处罚令程序。简易审判程序，是指对除可能判处无期徒刑案件外的所有刑事案件，被告人为获取刑罚的减轻，征得检察官的同意后，可以向法官提出适用该程序的申请，法官接受申请后仅根据侦查案卷就可以对案件作出迅速的判决的简易程序。参见王国枢、项振华：中外刑事诉讼简易程序比较[J]。中外法学，1999,3。）日本刑事诉讼法中规定了两种简易程序，对于没有争议的轻微刑事案件，需要经过审判程序的，可通过简易程序进行处理；不需经过审判的，可通过略式程序和交通案件即决裁判程序（已不再使用）处理。足见，制定一个多元的、功能齐备的简易程序体系，以适应刑事案件复杂性的客观实践要求，是世界各国通行的作法。而适用这些程序，尽管各国的规定多有不同，但许多程序可以由控辩双方采取明示或默示的合意来选择这一点是共同的。并且从各国的刑事诉讼制度发展趋势来看，这种合意的范围是逐步扩大的：
首先，各国刑事诉讼制度中普遍存在着区别于正式审判程序的辩诉交易程序（注：就其实质而言，辩诉交易制度中体现的合意既包括实体问题的合意，同时也包括程序问题的合意。包含实体内容是指，控辩双方就最终裁决的形式和内容达成协议，对权利进行处分。程序问题的合意是指控辩双方合意采用辩诉交易的形式而是不必经过正式的审理程序结案。），控辩双方可选择“交易”而避免正式的审理，从而达到节约诉讼成本及获得处罚上的实惠的目的。当然，由于诉讼模式和司法经验的不同，各国立法对双方协议的案件范围的规定各有不同。在美国，选择交易的案件范围很宽，“轻微和严重的罪行都可以通过答辩协议解决，从违反交通规章罪到死刑谋杀案件，被告和检察官都可进行答辩谈判”（注：［美］爱伦·斯切斯泰勒斯·黛丽，南希·弗兰克，美国刑事法院诉讼程序[M]，北京：中国人民大学出版社，2002年，416页。），控辩双方可在许多情况下合意决定案件是否经过陪审团或法官的审理。在德国，双方能够选择适用辩诉交易程序的案件限于对被告判处罚金、吊销驾驶执照等轻微刑事案件。在日本，对被告人判处5000元以下罚金、罚款以及判处缓刑、没收等附加处分的案件中控辩双方才能够选择交易。意大利的立法规定控辩协议只能减少被告人50%的罚金。而台湾地区最新的刑事诉讼修正草案规定的控辩双方能够“交易”的范围是：“认罪协商以被告所犯为死刑、无期徒刑或最轻本刑为三年以上有期徒刑以外之罪为限。”（注：苏秀慧：刑事诉讼法变革，认罪协商制度将设立[N]，民生报，2002,11,23。）
