侵害人对于商业秘密权利人可计算的财产、收入方面的损失，应全部予以赔偿。包括商业秘密的研制开发成本，使用或转让情况，市场的容量和供求关系，以及受害人营业额的实际减少量等。当然在实际操作中这种方法也有不少因素难以明确，例如权利人减少的营业额不一定全部是侵权人造成的，或不一定全部是这个侵权人造成的；权利人的商业秘密尚未推行市场，难以计算其可得利益的数额；市场的容量究竟有多大存在模糊性等。这些都需要人民法院在采用上述方法时加以考虑。
（2）以侵权人因侵权行为获得的利润为赔偿额。
具体来说，对于违法将商业秘密出卖给他人的，以其违法、出卖的收入为赔偿额；对于违法使用商业秘密进行生产经营活动的，以其获得或增加的利润为赔偿额。必要时，可委托知识产权评估机构或者专家进行评估。例如在广东电缆附件厂诉佛山高连电缆附件有限公司、陈灿等5人商业秘密侵权及佛山高连电缆附件有限公司反诉广东电缆附件厂不正当竞争纠纷案件中，广东电缆附件厂起诉认为其通过从德国引进35kv及以下电力电缆用硅橡胶预制件装配式附件技术和排除原任其厂长、其供销副科长的本案被告陈灿、陈永德等出国培训，并通过自行研发等方式，共生产、开发了16个系列149个品种的电力电缆用硅橡胶预制件装配式附件产品，拥有对这些产品的设计、制造、应用、质量控制和试验的专有技术，取得较好的经济效益，并对这些技术采取了保密措施，属于商业秘密。本案4被告原来分别是原告的厂长、车间主任、技术科长和销售科长，但却先后到高连公司出任要职，故意泄漏原告的商业秘密给高连公司并擅自将原告的商业秘密应用于高连公司，致使其生产出与原告相同或相近似的产品，给原告造成损失，请求判令5被告停止侵权和赔偿经济损失900万元等。佛山市中级人民法院和广东省高级人民法院在一、二审中根据案件的具体情况，均认定5被告使用了原告的商业秘密，构成侵权。同时，根据高连公司从1995年6月到1998年5月的产品销售收入36539460.27元，以及广东电缆附件厂主要产品平均利润率27.47%，按照高连公司的产品销售收入乘广东电缆附件厂的产品利润率计算，高连公司的可得利润为36539460.27元乘以27.47%等于10037389.73元。该数额已超过广东电缆附件厂诉请赔偿的900万元。此外，广东电缆附件厂还付出调查取证费、审计和翻译费用等，因此，法院全额支持了广东电缆附件厂900万元赔偿的诉讼请求。
（3）以不低于商业秘密使用许可的合理使用费为赔偿额。
