(三)责任范围不同
违约损害赔偿通常依当事人的事先约定，赔偿范围不得超过订立合同时应当预见到的违反合同可能造成的损失。此外，违约责任主要是财产损失的赔偿，不包括对人身伤害的赔偿和精神损害的赔偿责任；而侵权责任的赔偿范围不仅应包括直接损失，还应包括间接损失。损害赔偿不仅包括财产损失的赔偿，而且包括人身伤害和精神损害的赔偿。在医疗损害赔偿责任中，如果受害人(患者方)以违约损害赔偿行使请求权，而这一请求权的标的主要是人身伤害，与合同债务没有关系。因此，难以享受到违约责任中应当预见到的财产利益。如果受害人(患者方)以侵权损害赔偿行使请求权。加害人在承担财产损失的同时，还要承担因其医疗损害行为给患者方造成的精神损害赔偿。笔者认为，以侵权责任处理医疗损害赔偿比较符合对受害人利益的保护。当然，在这两种责任之间应当允许当事人自由选择。
(四)免责条件不同
免责条件又称免责条款，是指对法律规定的当事人应负担的责任予以特别免除或减轻的约定。当合同当事人对法律上禁止免责的事项及违反公序良俗的事项之外的内容规定免责时，法律一般认定有效。合同法和侵权行为法对免责条款的效力规定有所不同。在违约责任中，行为人只要实施了违约行为，且不具有有效的抗辩事由，就应当承担违约责任。除了法定的免责条件以外，合同当事人可以事先对有故意或重大过失责任以外的事项约定不承担责任。而在侵权责任中，在当事人之间不存在权利义务关系的约定，也就不承认免责条款的效力。侵权行为法中的免责条件或原因一般只能是法定的，当事人不能事先约定免责条件，也不能对不可抗力的范围事先约定。在医患关系中，医方通常使用要求患者方签订住院誓言书、手术同意书等形式来实现免责，要求对治疗中发生的损害不得提出异议。在司法实践中，对这种免责条款，一般以违反公序良俗或有失公平为由认定无效。
(五)受害人亲属是否享有损害赔偿请求权不同
在医疗损害赔偿上按照合同的相对性原则，只有合同双方当事人可以享有合同所产生的权利义务，合同的损害赔偿请求权只能由当事人本人享有，其亲属不能成为请求权人。在侵权行为法上受害人的亲属则有权行使损害赔偿请求权。
(六)行使请求权的时效不同
违约责任与侵权责任的诉讼时效在各国法律上都有不同的规定。如在日本民法中，合同损害赔偿请求时效为10年；而侵权行为的损害赔偿请求时效为被害人或其法定代理人知道侵权行为发生起3年或侵权行为发生时起20年。我国《民法通则》规定，因侵权行为所产生的损害赔偿请求权一般适用2年的时效规定，但因身体受到伤害而产生的损害赔偿请求权，其诉讼时效期间为1年。而违约责任损害赔偿请求权的一般时效为2年。医疗损害赔偿的受害人，依据《合同法》提起违约之诉，其行使请求诉讼时效一般为2年，而依据侵权行为法提起侵权之诉，其行使请求权的诉讼时效为1年。此外，《民法通则》还规定了20年的除诉期间。
