（3）制定农业生产的节水政策和措施。赋以政府和农民实施节水农业生产方式的义务，同时制定相关的鼓励措施。
（4）赋予地方政府义务，强制实施国家有关调整农业产业结构的政策，积极实施退耕还林、还草、还湿地等措施。
（5）鼓励建设封闭性的生态农场，提高农业生产废弃物的综合利用水平和农民生活垃圾处置率。
（6）水环境影响评价制度
鉴于水资源是我国农业可持续发展的最重要的资源，其一旦被污染和破坏后的难恢复性和不可逆性，迫切需要建立农业水资源的影响评价制度，对影响水资源的一切活动进行影响评价，禁止对水资源造成不可逆影响的开发利用活动。
（二）完善我国农业水资源保护的法律体系
法律作为治理环境和管理水资源的一个重要手段，其自身也存在着诸多的问题，如法律的滞后，主要体现在现行的法律由于环境的变化及人们生活习惯和生活方式的变迁不能适应社会发展的需要，致使原本用以维护社会秩序、促进社会良性发展的法律成为社会进步与发展的障碍。另外，由于立法主体的多元化可能出现法律、法规之间的不协调，这会给法律的适用和执行带来问题，使得司法和执法陷入困境。还有一种情况是社会现象千差万别且不断变化，新问题新现象层出不穷，法律如果忽视了对新问题的研究就会使得社会管理出现法律真空。法律本身的这些弊端也决定了在社会管理过程中必须重视立法的完善。
基于此，建议国家应对《
环境保护法》、《
水污染防治法》、《
水法》、《
水土保持法》、《
防洪法》等法律法规中有关农业水资源保护的相关规定，加以修改和完善。减少包括管理体制、管理机构职能等在内的法律间相互冲突的地方，增加相互关联性，以适应农业水资源保护、管理的需要。为此笔者认为，应当重点完成以下两项工作：其一，综合分析涉农水法律、法规，根据法的效力层次，把相关的条款修改和完善，解决相关法律、法规的冲突和不协调，从而解决司法和执法过程中存在的难题；其二，修改现有法律，加大对水环境污染的责任单位和个人的处罚力度，明确责任归属，从而解决水污染成本过低、法律威慑力不高的问题。违法成本提高了，处罚力度加大了，组织和个人就不敢肆意排污，无视法律、法规的存在。
（三）改革农业水资源保护的管理体制
国际上公认，有效的管理可以节水50%左右，而在我国，水资源的不恰当利用很大程度上是农业水资源管理机制落后、失效造成的。因此，改革农业水资源保护的管理体制势在必行。
改革的基本思路是：水资源应该由一个部门管理。从国外的经验看，大多数国家是由一个部门管理，或者水利部门，或者环保部门，这样有利于统一协调。
1、实行水质、水量的统一管理
水资源的质和量是不可分割的统一体，发达国家和一些水资源管理比较好的国家都是把水质和水量放在一起管理。在我国现行的流域管理与行政区域管理相结合的体制下，国务院水行政部门对全国水资源实行的统一管理和监督工作。在国家的最高水行政部门，成立农业水资源管理委员会统一负责对农业水资源的开发、利用和保护，并在国家环保总局和水利部设有协调委员会，分别协调与这二个部门在水资源管理、环境保护和资源保护方面的协作。
2、在地级以上的市建立城乡一体的水资源管理体系
以水资源可持续利用为目标，以提高水利用效率为核心，以水权管理为重点，建立城乡一体的水资源管理的政府宏观调控体制和市场经济调节体系，实现对一切涉水事务的统一管理，包括城乡防洪除涝、水源、供水、用水、节水、排水、污水处理及回用、水资源保护等全过程的统一规划、统一调度、统一管理等。
