第一，水权的客体不具有用益物权客体物的一般特征。一般用益物权的客体为不动产，且仅限于土地和建筑物。水权的客体为水资源，按照民法的界定，属于动产，并且还区别于民法上一般的动产，例如，水与土地的不可分离性、水的难以特定性等等，这就需要立法时考虑到水权的这些特殊性，将它与一般用益物权的立法区分开来。
　　
　　第二，水权在性质上属于公权性的私权。[22]这也不同于一般用益物权。水权是公权兼顾私权性质[23]。在当代德国，用水权被认为“是一种既有私法权利的性质，也有公法权利的性质的权利”[24]。法国学者将调整包括水的利用为内容的地役权称为“行政地役权”[25]。史尚宽认为“水权为跨公私法之独特权利”[26]。水权性质上的双重性是由水权客体的不同特征所致。一方面，水权所包括的水资源的使用权和收益权，建立在水资源的效用性、稀缺性、可控制性上。水权人可以将水资源作为财产的私人物品，对他进行排他性的支配，从而为自己创造财富。所以，水权于水权人而言，首先是一种私权。另一方面，因为水资源又附存着生态环境功能以及社会公共利益，需要政府采取非市场的手段加以提供和保护。所以水权是具有公权性质的私权。
　　
　　第三,水权在占有权能方面的特殊性。一般意义上的用益物权要求首先是占有标的物，然后才享有用益的权能。而水权具有两个关键的要素，一是占用的优先权，二是最大限度的有益用水。[27]前者是指就同一水资源先占有者拥有优先的水权，优先于其他水权人而占用,譬如,有西部地区的对雨水蓄集的优先使用权，对于地下雨而形成的地面径流，首先蓄集而加以利用者，则基于先占而享有了优先的水权。对于后者而言，是一种有益性用水，一旦用水的有益性缺失，那么水权将被剥夺。所以，体现在这一点上，水权不具有占有权，而仅具有占用的优先权。
　　
　　第四，水权的权利效力的特殊性。水权不具传统民法中用益物权的排他性。所有权和传统的用益物权利用排他原则来解决物权之间的效力冲突。而水权作为用益物权却不尽相同，在特定区域的水资源上可同时存在着数个水权。当水权人之间的利益发生冲突时，排他性原则无能为力，而采用优先权原则予以协调。而且受水权种类、特定时空水资源供需的实际情况、生态环境等因素的共同作用，水权的优先性具有相对的变化性。如，在生态环境特别恶劣的区域，环境水权具有较高的优先级，仅次于生活用水权；而在农业灌溉期，农业灌溉用水权的优先级较高。[28]

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