在简单商品经济中，在企业规模较小的时期，由于经济联系简单、账项记录较少、企业领导人可以实行事必亲躬的直接管理，内部审计也就相应实行账项导向审计。其基本方法是从原始凭证入手，逐项逐笔进行详实审核，审查账证、账物、账账、账表是否相符，力图通过凭证审核发现问题，达到查错防弊的目的。这是内部审计发展的最初阶段。这种审计方法，在有账可查的范围内可以做到全面、准确地审计，最大限度地揭示错弊，但耗费的时间和精力较多。随着社会经济环境的变化和企业经营规模的扩大，账项导向审计的局限性就日益凸显，逐渐退出其主导地位。

　　当简单商品经济发展为发达商品经济，企业经营规模发展到一定程度后，由于融资投资渠道和方式多样化、经济关系逐步复杂、经济往来账目浩繁、企业管理层次增多并建立了一定的管理制度，内部审计就自然地发展为制度导向审计。其基本方法是从评审企业的内控制度入手，找出其容易出现差错的薄弱环节；然后决定审计的重点范围，进行部分详实账项审计。这种方法可以提高审计效率、降低审计成本，并且可以通过完善内控制度防止以后出现差错。制度导向审计虽比账项导向审计进了一大步，但它只能在制度发生作用的范围内防止错弊，而不能防止制度以外的风险。

　　在现代市场经济时期，经济联系更为广泛，经济关系十分复杂。企业体制和规模已发展到有限责任公司、股份有限公司、以至企业集团；活动范围扩展到广阔的国内市场，并加入WTO融入世界经济一体化；融资方式有银行借贷、发行债券和股票以及补偿贸易；商品流通发展到远期交易、期货交易；经营业也有连锁经营、配送中心、总经销、总代理等。市场竞争日益激烈，企业面临的风险因素繁多，带来的风险损失越来越大。在这种环境下，内部审计必然要以风险审计为主导。其基本方法是对企业的决策、目标、计划、政策和控制制度、责任体系、监督体系以及经济活动的外在环境存在的风险因素进行全面的分析和评估，审查企业防范风险和化解风险的措施是否完备周到，并提出改进的建议和措施，以提高企业的整体管理效果，保证企业运营的安全和目标的实现。

　　我国地域广大，经济发展不平衡，各企业所处的环境和经营规模不一样，因而内部审计所处的发展阶段也不一致。三个不同阶段的审计方法也不是互相排斥，而互相结合并行不悖的。但在市场经济迅速发展的社会大环境中，风险导向审计应处于主导地位，三种审计方式要结合进行、各有侧重。对于规模较小的企业来说，应当以账项审计为主进行详实审计，同时也可进行内控制度评审和风险预测，帮助企业完善内控制度，防止出现风险损失。对于规模较大的企业来说，应以制度导向审计为主，有重点地进行账项审计，同时也进行风险预测和防范。对于大型的股份公司来说，则应把重点放在风险审计上，同时也要进行内控制度评审和有重点地进行账项审计，既帮助企业回避风险，又帮助企业完善内控制度，查找差错和舞弊。