同样，传统中医药产业的发展对中国药用野生动植物资源的影响也是致命的。野生中药材资源（包括植物药和动物药资源）是在一定的气候条件下、生态环境下形成的自然群体。在保持生态环境不变的前提下，其自然更新短则一、二年，长则数十年，甚至上百年。自然资源是人类赖以生存的大环境，通过开发资源，人类可以解决粮食、能源、药物等问题，满足人类物质文明需求，产生很好的经济效益；但如果过分地开发资源，造成生态环境破坏，物种毁灭，人类将永远失去该资源。药材资源的过度消费已给造成中药材资源枯竭和毁灭。80年代后期，甘草资源比50年代减少60%，麝香资源比50年代减少70%，其他如厚朴、杜仲、黄柏、黄芪、麻黄、肉苁蓉、松贝、冬虫夏草、蛤蚧等资源的破坏也十分严重。虎骨、犀角等，由于过分猎取，造成物种濒危，被列入一级保护动物，从而造成与其他有关的所有中成药停产，给我国的中药产业和健康事业造成了很大的损失；人参、霍山石斛、铁皮石斛等，其野生个体已很难发现，更不能形成资源，给这些品种的栽培、改良、组织培养、中药生产等造成很大的影响。
　　
　　（二）引起生物物种锐减
　　
　　由于人类对野生动植物的不当利用及过度消费等原因，物种目前正在以50倍地自然灭绝的速度消失。根据这个趋势，估计有34000种植物、5200种动物，其中包括1/8的鸟类面临绝种。虽然人类已经发展大量重要的食用栽培植物和家养动物，但是现代农业只关注较少的几种谷物品种，而且大约30%的主要农业家养动物高度濒危。生物多样性的丧失动摇了生态系统，弱化了生态系统抵御洪水、旱灾和暴风雨等自然灾害及污染、气候改变等人为压力的能力。
　　
　　虽然中国具有高度丰富的物种多样性，但由于近年来人口的快速增长与经济的高度发展，增大了对资源及生态环境的需求，构成了强大的压力，致使许多动物和植物严重濒危生态稳定性大大减低。从中国的生物和自然资源的科学调查所积累的大量资料初步统计，大约有398种脊椎动物和1009种高等植物濒危（见表中国科学公布的主要生物类群的濒危物种数目、比率）。
　　
　　2001年5月中国科学院生物多样性研究课题组公布的数据
　　
　　类群　　物种总数　 濒危物种数　 濒危物种比率%
　　
　　脊椎动物
　　
　　哺乳类　　499　　 94　　 18.8
　　
　　鸟类　1186　　183　　15.4
　　
　　爬行类　　376　　 17　　 4.5

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