大州与小州的分歧尚未解决妥当，又在计算众议院代表比例人口，黑人奴隶是否计算在内的问题上，出现了南方代表与北方代表的争执。南方代表希望黑人奴隶在分配直接税时算财产，选举时算人口，北方代表则认为黑人奴隶在征收财产税时算财产，国会选举时也不算人口。双方妥协的结果就是
宪法中的五分之三条款，即黑人奴隶按五分之三折算人口，并依此计算课征直接税和分配众议员名额。美国宪法也因此容忍了奴隶制而臭名昭著，直到今天受人诟病。
除此之外，在总统的选举方式上有人主张由民众直接选举，有人反对，妥协的结果就是总统选举人制度；还有在总统的权限，中央政府的商业管理权等方面都进行了激烈而又认真的讨论。【41】直到9月17日，对如何处理会议记录及相关文件问题进行最后一次投票后，美国宪法经过了569次投票表决终于制定出来，可谓一波三折，好事多磨。
当然，妥协并不等于没有原则。之所以作出妥协，实是代表们“不愿意看到制宪会议作鸟兽散，陷国家于不堪。”只有双方互相让步，美国宪法才能在一次次讨论和修改中不断完善，不断接近“政治真理”，进而实现最高目的和坚持最高原则。当时迫于形势，挽救13个邦的命运已迫不及待，如果代表们不能提出办法，就背叛了人民的委托，所以代表们对这次会议和将要制定的
宪法也可谓一往情深。妥协的原则是：第一、制宪会议不能一事无成；第二、国家不能分裂，必须联合和统一；第三、联合和统一不能通过战争，只能通过谈判。可以说，正是这三条原则，决定了他们在具体问题上的最后妥协。因为不在具体问题上妥协，就无法实现最高目的和坚持最高原则。惟有如此，制宪会议才阴云与曙光同在，妥协与原则共存。【42】
神佑美利坚
人心有许多计划，却只有主的目的才能成就。
——《旧约•箴言》19：21
谁敬畏耶和华，耶和华必指示他当选择的道路。
——《旧约•诗篇》25：12
用美国人常用的一句话来说，这是“最后，但不是最不重要（last but not least）”的一点。我之所以把这一条放在最后，是因为在我们这个没有信仰的国度，读者是不大会相信神灵的保佑，以此作为美国制宪会议成功的一个法则，实属无稽之谈，多有画蛇添足之嫌。但对于有着虔诚信仰的美利坚民族来说，这恐怕是不可或缺，甚至是至为重要的“压轴性”一点。
“神佑美利坚（God bless American）”是美国总统在公开演讲结束时常要说的一句话，意在表明美利坚人民的事业就是上帝的事业。在商定建国之策的制宪会议上，熟悉上帝意旨的代表们当然知道“敬畏耶和华是智慧的开端，认识至圣者便是聪明”。【43】在如此重大的事情上肯定不会忘记所罗门的劝告：“你要专心仰赖耶和华，不可依靠自己的聪明，在你一切所行的事上，都要认定他，他必指引你的路”【44】所以会议一开始，富兰克林老先生就提议请一位牧师，主持每天会议开始前的祷告仪式，但限于制宪会议的经费缺乏，只能改由每位代表回家祈祷。直到会议进行一个月后，辩论表决来回折腾，越过了一个又一个严重分歧，终于在无可回避的议会第二院代表制问题上相持不下。表面上大州和南方联盟占了多数，但小州已明确表态，如果再要他们退让，就只能退出会场。代表们为此争得暗无天日，却进展甚微，以致要作鸟兽散，打道回府。此时，会议中最年长，也是很少发言，有着智慧象征的富兰克林先生站起来，意味深长地说：
自从我们忙忙碌碌寻找政治智慧以来，我们确实体验到我们在政治智慧方面的缺乏……这个会议目前的处境，大家仿佛都在黑暗中摸索，寻求政治真理，却很少有人在发言中指出，事情怎么会弄成这样。主席先生，迄今为止，为何我们从未谦恭地祈求于光明之父，让他来启迪我们的悟性？在与英国抗争的开始阶段，我们对危险十分敏感，每天都要在这个房间里祈祷，祈求神明的庇护。我们的祈祷被听到了，并且被得到仁慈的回答。所有我们这些投身斗争的人，都频频体验到这位至高无上的神明，在保佑我们。……我已经活了很长的时间，活的时间越长，越相信我见到这个真理的存在：是上帝在主宰人间的事务。连一只麻雀掉到地上，也逃不过他的注意，那么没有他的帮助，一个帝国岂能兴起？……‘除了主能建成大厦，他们劳累而想建成大厦，不过是徒劳’。我坚信这一点，我还相信，没有他的协力帮助，我们要想建造这座政治大厦，不会比巴比伦人建造他们的通天塔下场更好。【45】
