联邦专利法院现共有116名法官，其中有62名法律法官与54名技术法官[6]，其他公职人员有144名。院长对院内的法官、公务员、雇员及其他工作人员进行监管。
联邦专利法院现有29个审判庭，分为上诉庭(Beschwerdesenate)与无效庭(Nichtigkeitssenate)。其中共有4个无效庭，25个上诉庭。25个上诉庭中有1个实用新型上诉审判庭、13个技术上诉审判庭、9个商标上诉审判庭、1个品种保护上诉审判庭和1个法律上诉审判庭。
其中，实用新型审判庭负责实用新型与集成电路布图设计方面的案件；13个技术审判庭之间有明确的领域分工，例如：第六技术审判庭主要负责水利、建筑、基础设施建设等方面的纠纷；第七技术审判庭主要负责机械制造领域的案件，如航天及航海机械工业、制冷制热机械、发动机等；第九技术审判庭主要负责交通工具行业，如汽车、火车、航空器制造业等。
由于不涉及技术问题，所以商标上诉审判庭、法律上诉审判庭和特定程序中的实用新型上诉审判庭的审判人员由3名法律法官组成。除此之外，其他上诉庭在审理不同类型的案件时，必须根据单行法的相关规定对法律法官与技术法官进行混合委任。
——技术审判庭由4人组成，1名法律法官和3名技术法官。由技术法官担任审判长；
——无效庭在审理专利无效、授予或撤销强制许可、调强制许可使用费及强制许可程序中的临时处分(einstweilige Verfuegung)[7]案件时，共有5名审判人员。由一名法律法官担任审判长，再由另外一名法律法官和三名技术法官担任审判员（
专利法第
67条）。除这些案件外，无效庭由三名法官组成，其中至少有一人是法律法官（一般情况下由两名法律法官和一名技术法官组成）；
——品种保护审判庭由2名技术法官和2名法律法官组成，审判长由法律法官担任(品种保护法第34条第5款)，但如果案件只涉及品种保护法第30条规定的品种名称变更时，则只需由三名法律法官组成。
无论在上诉庭还是无效庭，只有被委任参与审判的法律法官与技术法官才能对审理结果进行建议和表决。表决采用服从多数原则，出现表决数相同的情况时，以审判长的意见为主。表决必须依一定顺序进行。根据
专利法第
70条第3款，审判人员中工龄最短者最先表决，工龄相同时，年龄最小者最先表决。审判长最后表决。这种由不同领域的专业人员组合而成的审判庭对保障判决的正确与高效有着极其重要的作用。
