第二，《
国务院组织法》没有对国务院中行使国家行政权的组织机构作出任何规定。该法仅仅在第七条中规定了一个仅仅是内部办事机构的组织。内容是：“国务院设立办公厅，由秘书长领导。”这个办公厅，
宪法没有规定，也不宜规定，由《
国务院组织法》规定，符合
宪法的要求。遗憾的是，《
国务院组织法》没有根据
宪法的要求规定国务院中行使行政权的各种组织。第七条之外的各个条款，多为职权、程序方面的原则规定，没有规定国务院的具体组织。
第三，《
国务院组织法》将“国务院的组织由法律规定”之宪法规范变更成了“国务院的组织由全国人大或其常委会决定”。该法第八条规定：“国务院各部、各委员会的设立、撤销或者合并，经总理提出，由全国人民代表大会决定；在全国人民代表大会闭会期间，由全国人民代表大会常务委员会决定。”“规定”变成了“决定”，一字之差，差之毫厘，谬之千里。“国务院的组织由法律规定”，意味着国务院每增加一个机构，都必须修改《
国务院组织法》，已经规定好的东西，老去修改它，给人不尊重前人、不尊重传统、不尊重祖制的印象，会严重影响到立法机关的形象。所以，经常修改《
国务院组织法》是不可能的，至少要间隔三五年才能修改一次，相应的，国务院的机构膨胀就相对困难一些。“由全国人大或者它的常委会决定”，则意味着国务院增加机构只要全国人大常委会同意就可以了，全国人大常委会每两个月就开一次会，每次开会都要决定一些事情，自然也可以决定国务院的机构的增加，每做出一个这样的决定，也都能显示出全国人大常委会似乎很有权威，这样，国务院的机构膨胀就很方便了。
第四，《
国务院组织法》授权国务院自行设立机构。该法第十一条规定：“国务院可以根据工作需要和精简和原则，设立若干直属机构主管各项专门业务，设立若干办事机构协助总理办理专门事项。每个机构设负责人二至五人。”什么叫“直属机构”？难道国防部、外交部等等不是国务院的“直属”机构而是国务院的“间属”机构？什么叫“主管各项专门业务”？难道外交部、教育部、国防部主管的不是“专门”业务而是“普门”业务？这一条说白了就是：国务院增加机构其实也不需要全国人大或者它的常委会同意，报请全国人大或其常委会决定不过是个形式，万一人大不同意，也没有关系，就自行设立若干个所谓的“直属机构”好了。
（五）编制权——政权与治权
