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三、在土地征收的情况下，不但集体土地所有权归于消灭，而且存在于原集体所有土地上的土地承包经营权、宅基地使用权也随之终止。如果这些土地使用权从未登记过，此类土地权利终止的法律效力不但发生在征收人（国土资源管理机关）与被征收人（集体土地所有权人、房屋所有权人），以及利害关系人（土地承包经营权人、宅基地使用权人）之间，而且对任何第三人也产生法律拘束力；虽然土地权利已经办理了登记手续，不过在征收之时便涂销了土地承包经营权、宅基地使用权的登记，土地权利终止的法律效力仍然适用上述规则；在土地权利已经办理了登记手续，土地征收之后尚未涂销土地权利登记的情况下，土地权利终止的法律效力发生在征收人（国土资源管理机关）与被征收人（集体土地所有权人、房屋所有权人），以及利害关系人（土地承包经营权人、宅基地使用权人）之间，不会改变，但在与其他人之间的关系方面，此类土地权利的终止对抗不了善意第三人。例如，在征收人怠于发布征收公告的情况下，“四荒”地的承包人依法将其土地承包经营权转让给他人，该他人通过查阅土地登记簿知晓承包人享有土地承包经营权、发包人享有集体土地所有权，却检索不到该宗土地已被征收、存在于该宗土地之上的土地承包经营权已经终止的信息，于是，征收人（国土资源管理机关）对该土地承包经营权的受让人主张土地承包经营权已经终止时，受让人有权抗辩，主张自己已经拥有该土地承包经营权。但在征收人已经及时发布征收公告的情况下，应当推定为第三人已经知晓了征收的事实，该第三人此时与被征收人签订土地承包经营权转让合同，至少构成重大过失，属于恶意，无权否定征收的法律效力。
四、在征收人（国土资源管理机关）与被征收人（集体土地所有权人、房屋所有权人）之间，发生被征收的土地归国家所有、集体土地所有权终止的法律效果，这比较清楚。疑问在于，是征收人（国土资源管理机关）向被征收人（集体土地所有权人、房屋所有权人）给予充分补偿，还是由用地人支付补偿款？中国台湾的《土地征收条例》采取的是用地人支付补偿款的模式。在中国大陆，有的采取用地人（开发商）直接与被征收人签订合同，约定补偿款及其计算标准、支付时间和数额的模式；有的则是征收人（国土资源管理机关）直接与被征收人签订合同，约定土地补偿款及其计算标准、支付时间和数额，被征收房屋的补偿由用地人（开发商）与房屋所有权人签订合同，约定房屋的补偿款及其计算标准、支付时间和数额。
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