政府必须监管非政府组织的设立和相关活动，避免非政府组织的消极作用，更要支持 和引导非政府组织实现独立性，保证非政府组织名副其实，其中的关键是在防止非政府 组织失控和保持非政府组织独立性之间寻求平衡，探索监管的科学途径，实现依法适度 监管。
第四，非政府组织的法律规制问题。对非政府组织适度的、合法的监管是政府的职责 所在，非政府组织的设立在各国都有登记或者备案规定，尽管各国规制的方法和程度有 所不同，例如德国的非政府组织和企业都在警署登记，有的国家则设有单独的登记机关 ，但是，对非政府组织的数量和活动有所掌握，则在各国都是共通的。目前我国对非政 府组织采取严格的注册登记制度，并且实行双重管理，即登记主管部门和业务主管部门 双重领导。在三个登记管理条例(即《社团登记管理条例》《民办非企业单位登记管理 暂行条例》和《
事业单位登记管理暂行条例》)出台之前，登记注册制度不很规范的情 况下，非政府组织的登记管理没有一个统一的口径，有的在民政部门登记，有的在业务 主管部门登记。三个登记管理条例进行修订后，全国对非政府组织进行了重新登记，对 非政府组织情况的掌握有所增强。另一个现象也值得引起深思，近年来登记在册的新增 非政府组织并不像人们想像的多，登记的比实有的要少，可以说，这和严格的登记制度 有直接的关系。部分非政府组织由于规模小、活动范围有限，不去进行登记；部分非政 府组织由于找不到主管部门而无法登记，被迫处于未登记状况；部分非政府组织则作为 企业登记，无法享受应得的税收优惠等等。具体的情况也比较复杂，比如以基金会为例 ，基金会一直被认为是准金融组织，没有划入非政府组织范围，所以由中国人民银行掌 握批准权。从性质上讲，基金会当属公益性组织，其设立的目的不是营利，因此需要还 原其本来面目，其登记管理事宜，应归属民政部门为宜，当然，对其监管力度并不能因 此而放松，要从财务会计等方面加强监管。[1]再比如行业组织与其他社团有着明显差 别，其与政府的关系更加密切，其运行方式和功能也比较独特，应以单独立法为宜。以 上问题都需要通过完善非政府组织法律制度来解决。
因此，对非政府组织加强引导，加强非政府组织的独立性和规范性，要靠非政府组织 自己的努力，使组织机构和运行方式更加适应发展的需要，增加可信度和创造性；还要 有健全的法律制度，为非政府组织的发展创造一个健康、积极和稳定的制度环境。
