入世对农村生态环境的影响也不容忽视。改革开放20多年来，我国农村环境建设虽然取得了嘱目的成就，但是农村生态环境形势依然严峻，从总体上看，污染在日趋严重，生态破坏的范围在扩大，程度在加剧。入世后畜牧养殖业会得到迅猛发展，会排放出大量的畜禽粪便，点源污染物将会增加。一项调查报告表明，1995年全国畜禽粪便为18亿吨，到1997年就上升到24亿吨，是全国工业固体废弃物的4倍。入世后，这个数字还可能上升。另一方面，会诱发过度放牧等不科学畜牧方式的泛滥，有可能对加剧我国的草原资源的破坏。如内蒙古自治区的羊绒出口，造成山羊放牧破坏植被问题。入世后污染会伴随着资本由城市向农村地区（小城镇）流动。入世会加快我国的农业现代化的步伐，由此也会面临着化肥、农药、生活污水等污染问题和秸秆焚烧问题，以及乡镇企业污染和小城镇水与大气污染的问题。入世后，一些大城市被淘汰的产品、技术、设备、工艺和产业有可能借机进入各乡镇企业，可能使最近几年刚出现转机的我国农村生态环境重新恶化。入世后小城镇会得到较大的发展，不断增加的水利工程建设、铁路公路建设和管线铺设等会对小城镇的自然资源造成严重破坏，导致水土流失、土地荒漠化、生境破碎化和岛屿化等生态破坏问题。同时，由于城镇化过程中与环境质量有关的基础设施建设的滞后，绿化工作不足，汽车、摩托车尾气排放可能严重超标而污染空气。还有一个值得关注的问题是，进入WTO后，中国一些地区的农产品因缺少竞争力而退出市场，影响这些地区的农村经济，大量农业劳动力需要转移到非农产业和城市。这部分人可能加大我国农村和城市的环境资源压力。
　　2、入世会影响贸易的内容及形式，从而造成一些新的环境问题
　　中国加入世界贸易组织之后，将在一定程度上改变我国对外贸易的内容及形式，这种改变会给我国造成一些新的环境问题。首先，我国加入WTO后，国外的转基因产品特别是转基因食品将越来越多的出现在国内市场上。同时，随着对外贸易交流的日益活跃，自由的全球性贸易使得有害物种的引入我国成为可能，而且这种趋势有愈演愈烈的迹象。而转基因生物和外来物种对整个生态系统将会带来什么样的长期影响，这方面尚未积累足以说明问题的科学依据，验证其合理与否可能要花费上百年或几百年的时间。这种情况下，转基因产品的大量进口和外来物种的引入可能会对我国的生物多样性、生态环境和人体健康构成潜在的风险与威胁，一旦出现差错，可能造成灾难性的后果。这方面我们曾付出了巨大的代价。

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