| 1981. | 中华人民共和国政府和澳大利亚政府关于澳大利亚继续在中华人民共和国澳门特别行政区执行领事职务的协定 | 19990908 |
| 1982. | 中华人民共和国政府和澳大利亚政府关于打击犯罪的合作谅解备忘录 | 19990908 |
| 1983. | 中华人民共和国政府和厄瓜多尔共和国政府科学技术合作协定 | 19990830 |
| 1984. | 中华人民共和国政府和菲律宾共和国政府关于菲律宾共和国驻中华人民共和国香港特别行政区总领事馆在中华人民共和国澳门特别行政区执行领事职务的换文 | 19990830 |
| 1985. | 中华人民共和国政府和塞舌尔共和国政府关于对所得避免双重征税和防止偷漏税的协定 | 19990826 |
| 1986. | 中华人民共和国、哈萨克斯坦共和国、吉尔吉斯共和国、俄罗斯联邦和塔吉克斯坦共和国国家元首比什克声明 | 19990825 |
| 1987. | 中华人民共和国、哈萨克斯坦共和国、吉尔吉斯共和国、俄罗斯联邦和塔吉克斯坦共和国国家元首比什凯克声明 | 19990825 |
| 1988. | 中华人民共和国、吉尔吉斯共和国和哈萨克斯坦共和国关于三国国界交界点的协定 | 19990825 |
| 1989. | 中华人民共和国政府和乌干达共和国政府文化协定二000至二00二年执行计划 | 19990824 |
| 1990. | 中华人民共和国政府和文莱达鲁萨兰国苏丹陛下政府文化合作谅解备忘录 | 19990823 |
| 1991. | 中华人民共和国政府和新西兰政府关于新西兰公民在中国收养中国儿童的换文 | 19990820 |
| 1992. | 中华人民共和国和塔吉克斯坦共和国关于进一步发展两国睦邻友好和互利合作关系的联合声明 | 19990813 |
| 1993. | 中华人民共和国和塔吉克斯坦共和国关于中塔国界的协定 | 19990813 |
| 1994. | 中华人民共和国政府和塔吉克斯坦共和国政府关于禁止非法贩运和滥用麻醉药品、精神药物和管制化学品前体的合作协议 | 19990813 |
| 1995. | 中华人民共和国政府和塔吉克斯坦共和国政府汽车运输协定 | 19990813 |
| 1996. | 中华人民共和国政府和日本国政府关于销毁中国境内日本遗弃化学武器的备忘录 | 19990730 |
| 1997. | 《建立亚洲太平洋促进广播发展机构协定》修正案 | 19990721 |
| 1998. | 中华人民共和国政府和蒙古国政府关于边境地区森林、草原防火联防协定 | 19990715 |
| 1999. | 中华人民共和国政府和柬埔寨王国政府关于柬埔寨王国驻中华人民共和国香港特别行政区领事馆升格为总领事馆的换文 | 19990708 |
| 2000. | 中华人民共和国政府和摩洛哥王国政府关于商业航运领域的协定 | 19990705 |
| 2001. | 中华人民共和国政府和伊朗伊斯兰共和国政府关于伊朗伊斯兰共和国在中华人民共和国香港特别行政区设立总领事馆的换文 | 19990705 |
| 2002. | 工业品外观设计国际注册海牙协定(日内瓦文本) | 19990702 |
| 2003. | 《散装运输危险化学品船舶构造和设备规则》(BCH规则)1999年修正案 | 19990701 |
| 2004. | 中华人民共和国政府和科威特国政府关于科威特国在中华人民共和国香港特别行政区设立总领事馆的换文 | 19990630 |
| 2005. | 关于简化和协调海关业务制度的国际公约修正案议定书 | 19990626 |
| 2006. | 中华人民共和国外交部和毛里塔尼亚伊斯兰共和国外交合作部定期政治磋商协定 | 19990621 |
| 2007. | 禁止和立即行动消除最恶劣形式的童工劳动公约 | 19990617 |
| 2008. | 中华人民共和国政府和巴林国政府关于鼓励和相互保护投资协定 | 19990617 |
| 2009. | 中华人民共和国政府和巴林国政府关于互免空运企业国际运输收入税收的协定 | 19990617 |
| 2010. | 中华人民共和国政府和智利共和国政府一九九九至二00一年文化交流执行计划 | 19990616 |
